21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6600 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  45.08 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  42.62 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  40.16 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  43.09 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  35.29 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  35.16 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  39.52 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  34.13 
 
 
264 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  34.13 
 
 
264 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  32.03 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  29.84 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  26.77 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  26.45 
 
 
311 aa  55.1  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  25.19 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  28.23 
 
 
797 aa  53.9  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  30.89 
 
 
153 aa  48.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0400  hypothetical protein  28.46 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.496255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>