22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5496 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  43.85 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  38.93 
 
 		 163 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 264 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  37.98 
 
 		 156 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 264 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 263 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  33.59 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  33.59 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  35.48 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  31.3 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  32.03 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  29.79 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  27.64 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  26.83 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  22.83 
 
 		 311 aa  57  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  29.79 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  29.46 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  29.92 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  27.86 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>