90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0718 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  44.08 
 
 
263 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  37.01 
 
 
142 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  35.48 
 
 
161 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  37.8 
 
 
156 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  34.65 
 
 
163 aa  85.1  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  39.84 
 
 
124 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  32.8 
 
 
124 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  34.13 
 
 
124 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  30.65 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  30.99 
 
 
140 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  30.08 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 
103 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  47.14 
 
 
124 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  50.85 
 
 
95 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  50.85 
 
 
118 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
100 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 
100 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 
110 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  49.15 
 
 
127 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
100 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  25.17 
 
 
797 aa  54.3  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 
124 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  38.98 
 
 
99 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  38.98 
 
 
99 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
100 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  41.67 
 
 
103 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
100 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  37.35 
 
 
103 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  43.08 
 
 
100 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  25.68 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl470  Cro/CI family transcriptional regulator  26.71 
 
 
139 aa  50.8  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00205388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 
100 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
91 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
123 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  38.67 
 
 
103 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  36.99 
 
 
149 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
91 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
114 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
107 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 
103 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
91 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
110 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
109 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
103 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
97 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
97 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 
215 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  34.21 
 
 
383 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3973  hypothetical protein  27.97 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0948088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  35.71 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
117 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 
497 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 
188 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  48.08 
 
 
80 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 
1642 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
112 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
179 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
99 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
94 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
94 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
91 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
171 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  31.88 
 
 
95 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 
168 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
115 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
91 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3165  hypothetical protein  27.21 
 
 
133 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
104 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
104 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
104 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 
825 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
406 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>