83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1578 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.65 
 
 		 1722 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  37.13 
 
 		 1748 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  36.15 
 
 		 1702 aa  895    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.41 
 
 		 1932 aa  788    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1642 aa  3355    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  39.85 
 
 		 1649 aa  1031    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  31.8 
 
 		 2570 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  37.74 
 
 		 1417 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  36.51 
 
 		 1925 aa  824    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  36.52 
 
 		 1697 aa  879    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  35.21 
 
 		 1693 aa  870    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 1575 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  37.48 
 
 		 1606 aa  830    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  38.5 
 
 		 2077 aa  1115    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  36.75 
 
 		 1697 aa  880    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  36.92 
 
 		 1701 aa  874    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  75.59 
 
 		 1669 aa  2535    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  75.09 
 
 		 1669 aa  2497    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 1516 aa  844    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  38.28 
 
 		 2098 aa  985    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  42.63 
 
 		 1726 aa  1239    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  41.77 
 
 		 1706 aa  1240    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  36.82 
 
 		 1703 aa  887    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  37.56 
 
 		 1700 aa  900    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.21 
 
 		 1934 aa  775    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 1674 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  33.4 
 
 		 1594 aa  602  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  31.95 
 
 		 2274 aa  597  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  35.17 
 
 		 1211 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.73 
 
 		 2117 aa  580  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  39.1 
 
 		 2005 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  36.62 
 
 		 976 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  32.86 
 
 		 1956 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  33.96 
 
 		 763 aa  293  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 761 aa  292  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  30.24 
 
 		 766 aa  240  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  36.06 
 
 		 470 aa  200  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  34.82 
 
 		 526 aa  157  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 577 aa  154  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  35.16 
 
 		 284 aa  106  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.57 
 
 		 1379 aa  95.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  26.25 
 
 		 678 aa  94  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  25.95 
 
 		 442 aa  92  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.92 
 
 		 1328 aa  85.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.19 
 
 		 339 aa  70.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  26.98 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  26.59 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  28.64 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 669 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  26.15 
 
 		 468 aa  54.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.57 
 
 		 894 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  24.04 
 
 		 315 aa  52.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 969 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.37 
 
 		 919 aa  50.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.52 
 
 		 953 aa  50.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  25.9 
 
 		 946 aa  50.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.33 
 
 		 466 aa  50.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  28.91 
 
 		 889 aa  50.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5012  helicase domain protein  33.6 
 
 		 1055 aa  50.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.07 
 
 		 490 aa  49.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  34.48 
 
 		 872 aa  49.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  27.78 
 
 		 604 aa  48.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 941 aa  48.9  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 941 aa  48.9  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  32.69 
 
 		 569 aa  48.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  32.35 
 
 		 945 aa  48.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 707 aa  47.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  29.63 
 
 		 958 aa  47.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  30.22 
 
 		 356 aa  47.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  36.36 
 
 		 958 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.54 
 
 		 1065 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  27.78 
 
 		 922 aa  47.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.18 
 
 		 933 aa  47.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.54 
 
 		 1065 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  33.72 
 
 		 900 aa  46.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  24.52 
 
 		 572 aa  46.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  25.53 
 
 		 1045 aa  46.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  30.53 
 
 		 246 aa  46.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 1116 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.32 
 
 		 1147 aa  46.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  30.36 
 
 		 950 aa  45.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.67 
 
 		 1057 aa  45.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  30.23 
 
 		 478 aa  45.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>