More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2648 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  46.59 
 
 
953 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  43.47 
 
 
986 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
968 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  100 
 
 
950 aa  1907    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  41.06 
 
 
949 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  43.55 
 
 
948 aa  615  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  37.44 
 
 
958 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  36.79 
 
 
958 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  41.78 
 
 
933 aa  582  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  40.39 
 
 
957 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  39.76 
 
 
969 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  38.56 
 
 
953 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  43.82 
 
 
940 aa  545  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  39.42 
 
 
946 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  38.69 
 
 
945 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  37.21 
 
 
941 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  37.07 
 
 
919 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  36.71 
 
 
923 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.41 
 
 
949 aa  486  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  34.97 
 
 
933 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.99 
 
 
952 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.66 
 
 
919 aa  333  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  53.17 
 
 
313 aa  268  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.55 
 
 
964 aa  197  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  31.64 
 
 
1058 aa  195  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.19 
 
 
1049 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.9 
 
 
988 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.4 
 
 
1165 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.92 
 
 
971 aa  177  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.6 
 
 
1045 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.98 
 
 
969 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
1145 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.33 
 
 
1062 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.52 
 
 
1136 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 
933 aa  171  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.65 
 
 
969 aa  171  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.33 
 
 
962 aa  171  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 
1031 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.97 
 
 
1057 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.51 
 
 
1160 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.89 
 
 
877 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  26.38 
 
 
1177 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.2 
 
 
954 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
941 aa  167  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
941 aa  167  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
1046 aa  167  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.23 
 
 
1172 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.25 
 
 
952 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.25 
 
 
952 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 
1170 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.07 
 
 
952 aa  164  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.39 
 
 
1169 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  27.5 
 
 
1201 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
1201 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.24 
 
 
1137 aa  162  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  29.11 
 
 
1044 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.46 
 
 
966 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.75 
 
 
945 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 
1169 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  27.44 
 
 
952 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.31 
 
 
801 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  26.69 
 
 
1170 aa  157  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.96 
 
 
1013 aa  157  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.81 
 
 
829 aa  157  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.37 
 
 
960 aa  157  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.17 
 
 
1082 aa  157  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 
937 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.81 
 
 
805 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.31 
 
 
1168 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  26.91 
 
 
1170 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.83 
 
 
1116 aa  155  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.77 
 
 
1028 aa  155  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 
1172 aa  155  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.75 
 
 
1138 aa  154  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28 
 
 
972 aa  154  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  30.19 
 
 
973 aa  154  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  26.49 
 
 
1129 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  29.66 
 
 
1094 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.46 
 
 
1147 aa  152  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.67 
 
 
1212 aa  152  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.74 
 
 
1160 aa  152  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 
1167 aa  151  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
1167 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.56 
 
 
1144 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.88 
 
 
835 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 
1167 aa  148  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.13 
 
 
1170 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.33 
 
 
937 aa  142  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
982 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.5 
 
 
1095 aa  141  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.88 
 
 
900 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 
1046 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 
669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.53 
 
 
894 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
967 aa  128  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
947 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  26.98 
 
 
1069 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1069 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.77 
 
 
961 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.48 
 
 
927 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>