More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1920 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  100 
 
 
971 aa  1967    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  73.29 
 
 
969 aa  1457    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  34.96 
 
 
988 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.09 
 
 
1116 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.72 
 
 
1129 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
1170 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.81 
 
 
952 aa  293  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 
1172 aa  293  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 
1167 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
1167 aa  288  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.72 
 
 
1168 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.26 
 
 
1138 aa  287  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
1167 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.1 
 
 
1160 aa  283  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.5 
 
 
1170 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 
933 aa  278  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.94 
 
 
1144 aa  278  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
941 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
941 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.09 
 
 
919 aa  274  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.1 
 
 
1194 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.54 
 
 
1212 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.2 
 
 
1160 aa  273  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.22 
 
 
972 aa  273  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.56 
 
 
1172 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.85 
 
 
835 aa  270  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
1136 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.57 
 
 
1170 aa  269  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.14 
 
 
829 aa  269  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
1147 aa  269  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
1145 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1137 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  30.4 
 
 
1131 aa  263  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.23 
 
 
969 aa  261  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  31.6 
 
 
964 aa  260  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.91 
 
 
1169 aa  258  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.05 
 
 
966 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  34.59 
 
 
1045 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
1169 aa  255  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.31 
 
 
1046 aa  254  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.21 
 
 
801 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 
1031 aa  253  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  34.22 
 
 
962 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  32.25 
 
 
1062 aa  249  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.5 
 
 
927 aa  248  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.73 
 
 
805 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
877 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.32 
 
 
1170 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.35 
 
 
925 aa  241  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
937 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.31 
 
 
922 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
1058 aa  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  32.04 
 
 
1201 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.8 
 
 
1057 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
1201 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  32.01 
 
 
1165 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.21 
 
 
894 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  31.2 
 
 
900 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.72 
 
 
1049 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.57 
 
 
1038 aa  217  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.61 
 
 
1044 aa  217  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  30.6 
 
 
1094 aa  212  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  30 
 
 
1082 aa  208  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.64 
 
 
1028 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  31.49 
 
 
1095 aa  205  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  30.29 
 
 
1069 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
1069 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.84 
 
 
572 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
954 aa  200  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
906 aa  199  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
1177 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 
669 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.52 
 
 
945 aa  194  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
952 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.58 
 
 
968 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  28.49 
 
 
952 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.47 
 
 
952 aa  192  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.47 
 
 
952 aa  192  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.05 
 
 
964 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.8 
 
 
584 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.61 
 
 
967 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 
560 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  28.12 
 
 
932 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.24 
 
 
915 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  27.68 
 
 
923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  26.16 
 
 
560 aa  181  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.42 
 
 
949 aa  180  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
921 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.16 
 
 
560 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.72 
 
 
467 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.08 
 
 
916 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.56 
 
 
555 aa  180  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.08 
 
 
915 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.16 
 
 
560 aa  180  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.74 
 
 
584 aa  177  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>