More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3352 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  100 
 
 
919 aa  1825    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  34.93 
 
 
952 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  35.66 
 
 
950 aa  333  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  35.66 
 
 
953 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  34.8 
 
 
948 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  37.17 
 
 
949 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
968 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  36.15 
 
 
940 aa  308  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  33.86 
 
 
958 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  33.38 
 
 
986 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  32.68 
 
 
958 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  32.95 
 
 
941 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  32.23 
 
 
957 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  33.13 
 
 
933 aa  281  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  37.11 
 
 
969 aa  280  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.53 
 
 
988 aa  277  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  35.18 
 
 
946 aa  277  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
919 aa  275  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.37 
 
 
969 aa  273  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
945 aa  271  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
953 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.96 
 
 
971 aa  267  8e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  35.58 
 
 
923 aa  257  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.56 
 
 
949 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  34.12 
 
 
1049 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  33.85 
 
 
933 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.22 
 
 
1172 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  34.65 
 
 
1167 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  33.94 
 
 
1058 aa  235  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  37.02 
 
 
1194 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.17 
 
 
1116 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  34.8 
 
 
1160 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.32 
 
 
1057 aa  232  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  34.14 
 
 
1167 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  33.61 
 
 
1170 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.28 
 
 
1172 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  34.7 
 
 
1167 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  35.15 
 
 
1045 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  34.53 
 
 
1170 aa  227  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.73 
 
 
1028 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.98 
 
 
1212 aa  226  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
1129 aa  226  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  33.45 
 
 
1170 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
1046 aa  225  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.29 
 
 
1168 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  33.96 
 
 
1201 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 
1201 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  33.17 
 
 
1082 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  32.35 
 
 
1160 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  31.44 
 
 
945 aa  221  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  35.27 
 
 
1031 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  33.44 
 
 
1165 aa  218  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  34.32 
 
 
1170 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.98 
 
 
962 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
954 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.85 
 
 
966 aa  214  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
1169 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  31.89 
 
 
952 aa  214  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  31.89 
 
 
952 aa  214  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.23 
 
 
941 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.23 
 
 
941 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  34.34 
 
 
1169 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  32.79 
 
 
1062 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
933 aa  211  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.98 
 
 
969 aa  210  8e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  31.51 
 
 
952 aa  210  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  31.16 
 
 
1038 aa  210  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  31.09 
 
 
952 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  34.16 
 
 
1136 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.83 
 
 
835 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.83 
 
 
1144 aa  205  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  31.39 
 
 
1094 aa  205  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1147 aa  204  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
1145 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  33.64 
 
 
973 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
1137 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  32.48 
 
 
1095 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.86 
 
 
1138 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.01 
 
 
964 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.15 
 
 
960 aa  201  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.49 
 
 
1177 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  33.63 
 
 
829 aa  197  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  32.01 
 
 
956 aa  195  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
982 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.45 
 
 
972 aa  193  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  31.6 
 
 
937 aa  181  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.77 
 
 
584 aa  179  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
877 aa  178  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  29.39 
 
 
1013 aa  177  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  33.72 
 
 
1046 aa  177  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.17 
 
 
801 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.25 
 
 
584 aa  170  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.94 
 
 
805 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  30.61 
 
 
578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.55 
 
 
572 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.36 
 
 
560 aa  162  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.55 
 
 
560 aa  161  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.36 
 
 
560 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.17 
 
 
560 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.17 
 
 
560 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>