More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0202 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  50.08 
 
 		 1194 aa  1057    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  42.99 
 
 		 1131 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  47.88 
 
 		 1160 aa  984    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  60.59 
 
 		 1212 aa  1464    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  49.62 
 
 		 1168 aa  1077    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  44.72 
 
 		 1137 aa  853    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  50.3 
 
 		 1172 aa  1106    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  49.16 
 
 		 1167 aa  1055    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  56.65 
 
 		 760 aa  836    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  53.07 
 
 		 829 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  44.8 
 
 		 1136 aa  850    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  56.44 
 
 		 814 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  49.49 
 
 		 1167 aa  1053    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  72.03 
 
 		 1169 aa  1744    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  61.89 
 
 		 906 aa  1115    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  59.13 
 
 		 1170 aa  1409    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  49.79 
 
 		 1160 aa  1068    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  59.54 
 
 		 1172 aa  1462    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  73.01 
 
 		 1169 aa  1747    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  49.37 
 
 		 1167 aa  1053    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.41 
 
 		 1170 aa  1065    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  100 
 
 		 1170 aa  2387    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  57.62 
 
 		 1170 aa  1333    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 964 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  46.06 
 
 		 774 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  62.38 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  33.16 
 
 		 1145 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  33.84 
 
 		 1129 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 		 1116 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1144 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.59 
 
 		 1138 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.08 
 
 		 835 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1147 aa  355  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.25 
 
 		 565 aa  322  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.7 
 
 		 988 aa  318  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  34.1 
 
 		 1062 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  59.84 
 
 		 283 aa  310  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.16 
 
 		 922 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.66 
 
 		 1069 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 		 1069 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.35 
 
 		 925 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.21 
 
 		 969 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.5 
 
 		 927 aa  252  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.03 
 
 		 971 aa  246  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 877 aa  244  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 933 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.59 
 
 		 962 aa  232  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.6 
 
 		 801 aa  231  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 941 aa  230  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 941 aa  230  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.92 
 
 		 969 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.15 
 
 		 972 aa  229  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.93 
 
 		 805 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  45.91 
 
 		 312 aa  228  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.63 
 
 		 919 aa  226  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.31 
 
 		 966 aa  224  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.64 
 
 		 952 aa  221  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 1046 aa  219  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.58 
 
 		 894 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 1031 aa  216  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.39 
 
 		 1049 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.64 
 
 		 1057 aa  211  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 		 937 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.75 
 
 		 1058 aa  208  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.49 
 
 		 1045 aa  208  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.64 
 
 		 1165 aa  197  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.96 
 
 		 1038 aa  196  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.99 
 
 		 572 aa  191  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28.31 
 
 		 560 aa  185  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  28.31 
 
 		 560 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  28.14 
 
 		 560 aa  183  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.86 
 
 		 1201 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 1201 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.06 
 
 		 1082 aa  181  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28.31 
 
 		 560 aa  178  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.95 
 
 		 1095 aa  178  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  31.66 
 
 		 1177 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.83 
 
 		 1028 aa  175  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.64 
 
 		 953 aa  174  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.19 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 968 aa  174  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.97 
 
 		 584 aa  173  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 955 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  26.43 
 
 		 969 aa  171  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 953 aa  171  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  31.02 
 
 		 963 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.34 
 
 		 949 aa  166  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  29.28 
 
 		 948 aa  165  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 923 aa  165  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.58 
 
 		 961 aa  164  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 346 aa  163  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.72 
 
 		 554 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  27.77 
 
 		 961 aa  160  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.35 
 
 		 584 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.96 
 
 		 950 aa  160  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>