More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2539 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  53.02 
 
 		 953 aa  902    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  46.45 
 
 		 986 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 969 aa  1942    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  43.38 
 
 		 933 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  41.82 
 
 		 949 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  40.57 
 
 		 958 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  39.88 
 
 		 958 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  53.49 
 
 		 957 aa  946    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  44.47 
 
 		 968 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  40.91 
 
 		 948 aa  631  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  41.09 
 
 		 940 aa  598  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  40.89 
 
 		 953 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  40.78 
 
 		 945 aa  588  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  40.66 
 
 		 946 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  39.57 
 
 		 941 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  40.41 
 
 		 919 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  40.08 
 
 		 950 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  38.87 
 
 		 923 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.03 
 
 		 949 aa  568  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  37.15 
 
 		 933 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.19 
 
 		 952 aa  301  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  37.36 
 
 		 919 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  51.39 
 
 		 313 aa  248  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.89 
 
 		 1049 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.62 
 
 		 1057 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1046 aa  180  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.21 
 
 		 1028 aa  178  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 1058 aa  178  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1169 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.13 
 
 		 1169 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 1172 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.18 
 
 		 969 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  27.41 
 
 		 1172 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.44 
 
 		 971 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.09 
 
 		 1170 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 1177 aa  171  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.24 
 
 		 1062 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.06 
 
 		 1082 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.68 
 
 		 1031 aa  166  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.22 
 
 		 1045 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 		 1136 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.44 
 
 		 1038 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.31 
 
 		 1160 aa  163  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.43 
 
 		 933 aa  163  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.36 
 
 		 1194 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.22 
 
 		 1165 aa  162  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27 
 
 		 1170 aa  161  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.99 
 
 		 1201 aa  161  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1201 aa  161  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.34 
 
 		 1168 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.35 
 
 		 1095 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.6 
 
 		 969 aa  160  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.15 
 
 		 945 aa  160  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 954 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 1137 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.95 
 
 		 829 aa  158  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25.17 
 
 		 988 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1167 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 1013 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 962 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  25.38 
 
 		 952 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.3 
 
 		 1212 aa  155  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.48 
 
 		 972 aa  155  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  25.38 
 
 		 952 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  25.38 
 
 		 952 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 1147 aa  154  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1129 aa  154  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 1145 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  25.67 
 
 		 952 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 		 1170 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1167 aa  151  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.58 
 
 		 1160 aa  150  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.38 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.76 
 
 		 960 aa  149  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 964 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1167 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 941 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 941 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  26.13 
 
 		 801 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1144 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.57 
 
 		 835 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.12 
 
 		 805 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.05 
 
 		 937 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.85 
 
 		 966 aa  141  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  25.9 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.05 
 
 		 927 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.54 
 
 		 925 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 877 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  25.48 
 
 		 937 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  26.88 
 
 		 921 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.63 
 
 		 555 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.65 
 
 		 1138 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  33.13 
 
 		 1094 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  27.5 
 
 		 915 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  27.5 
 
 		 916 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.62 
 
 		 964 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.16 
 
 		 894 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1046 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  24.52 
 
 		 900 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.95 
 
 		 813 aa  127  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>