More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2134 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  82.92 
 
 		 922 aa  1573    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  82.72 
 
 		 925 aa  1593    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  100 
 
 		 927 aa  1884    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0106  helicase domain-containing protein  69.93 
 
 		 443 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  83.53 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.91 
 
 		 877 aa  297  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.4 
 
 		 988 aa  287  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  31.78 
 
 		 801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0104  hypothetical protein  79.03 
 
 		 297 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 1129 aa  258  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  32.27 
 
 		 1160 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 933 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.68 
 
 		 1172 aa  254  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.97 
 
 		 1170 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 941 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 941 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.33 
 
 		 900 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.18 
 
 		 1170 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.92 
 
 		 1170 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.76 
 
 		 894 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 1170 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.13 
 
 		 962 aa  243  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 1167 aa  243  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 1167 aa  243  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.1 
 
 		 1212 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.56 
 
 		 835 aa  241  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1144 aa  241  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.85 
 
 		 1172 aa  240  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 964 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 1145 aa  237  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1167 aa  237  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.15 
 
 		 1147 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 1137 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.9 
 
 		 972 aa  231  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.92 
 
 		 969 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.72 
 
 		 1169 aa  228  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.3 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.16 
 
 		 1138 aa  214  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.95 
 
 		 1062 aa  211  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  37.54 
 
 		 805 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 937 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  36.88 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  36.36 
 
 		 1194 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.9 
 
 		 1168 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.9 
 
 		 969 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.11 
 
 		 1045 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.76 
 
 		 1046 aa  170  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.79 
 
 		 1031 aa  168  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.64 
 
 		 1069 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1069 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  31.63 
 
 		 1160 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 947 aa  167  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.48 
 
 		 961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  35.28 
 
 		 971 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  29.73 
 
 		 440 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.34 
 
 		 966 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31 
 
 		 1169 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 942 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1136 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.41 
 
 		 1013 aa  157  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  26.73 
 
 		 960 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.71 
 
 		 1057 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.07 
 
 		 963 aa  153  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  28.1 
 
 		 949 aa  151  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.15 
 
 		 975 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.53 
 
 		 952 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.52 
 
 		 1165 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 967 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.67 
 
 		 932 aa  148  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.16 
 
 		 963 aa  148  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.58 
 
 		 1201 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 		 1201 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.12 
 
 		 1049 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.6 
 
 		 929 aa  143  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.72 
 
 		 1095 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  34.12 
 
 		 283 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.55 
 
 		 957 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 814 aa  140  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  25.25 
 
 		 964 aa  138  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.05 
 
 		 919 aa  138  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  25.27 
 
 		 1177 aa  138  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  25.94 
 
 		 953 aa  137  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1058 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.45 
 
 		 968 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  40.2 
 
 		 1065 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  40.2 
 
 		 1065 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  32.51 
 
 		 572 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.33 
 
 		 1082 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.07 
 
 		 949 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.27 
 
 		 960 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  35.78 
 
 		 967 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.91 
 
 		 584 aa  125  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.91 
 
 		 584 aa  124  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.13 
 
 		 554 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  37.68 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.53 
 
 		 950 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  33.9 
 
 		 947 aa  122  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  35.65 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  35.65 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  35.65 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>