More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  45.15 
 
 		 951 aa  751    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  62.86 
 
 		 947 aa  1158    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  100 
 
 		 929 aa  1897    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  44.89 
 
 		 955 aa  751    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  75.32 
 
 		 932 aa  1407    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  73.41 
 
 		 960 aa  1338    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  46.4 
 
 		 964 aa  779    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  50.59 
 
 		 949 aa  914    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  52.4 
 
 		 942 aa  922    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  49.89 
 
 		 966 aa  882    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  44.93 
 
 		 963 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  44.46 
 
 		 975 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  43.02 
 
 		 961 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  49.1 
 
 		 967 aa  861    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  42.62 
 
 		 963 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.64 
 
 		 961 aa  609  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  48.13 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  45.33 
 
 		 915 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  44.9 
 
 		 921 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  45.17 
 
 		 916 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  45.17 
 
 		 915 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  63.78 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  30 
 
 		 572 aa  210  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.66 
 
 		 584 aa  209  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.25 
 
 		 555 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.82 
 
 		 584 aa  201  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  29.52 
 
 		 554 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.61 
 
 		 988 aa  194  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 933 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 1129 aa  188  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.98 
 
 		 1147 aa  184  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.78 
 
 		 467 aa  181  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 		 1145 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1144 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.48 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 1116 aa  178  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.26 
 
 		 969 aa  177  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.38 
 
 		 1138 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.04 
 
 		 801 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.3 
 
 		 1062 aa  174  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.46 
 
 		 969 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.3 
 
 		 972 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.31 
 
 		 941 aa  170  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.31 
 
 		 941 aa  170  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.02 
 
 		 962 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.8 
 
 		 966 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.64 
 
 		 805 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  26.93 
 
 		 541 aa  162  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.34 
 
 		 900 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.12 
 
 		 1057 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.3 
 
 		 971 aa  150  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.92 
 
 		 1170 aa  150  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.8 
 
 		 1037 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 877 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 964 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.27 
 
 		 1160 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 		 1167 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.45 
 
 		 1170 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 1167 aa  144  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.48 
 
 		 1095 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.45 
 
 		 937 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 		 1167 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.23 
 
 		 1170 aa  141  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.05 
 
 		 1169 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1136 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  25.88 
 
 		 1137 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.02 
 
 		 829 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 1172 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  25.71 
 
 		 894 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 1169 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.54 
 
 		 1201 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 		 1201 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.29 
 
 		 1194 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.38 
 
 		 1168 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.85 
 
 		 1038 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.04 
 
 		 1170 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.06 
 
 		 1212 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.39 
 
 		 952 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.82 
 
 		 1172 aa  131  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  40.23 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 1046 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.23 
 
 		 1160 aa  129  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.29 
 
 		 1165 aa  129  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 560 aa  128  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.04 
 
 		 560 aa  128  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  39.04 
 
 		 560 aa  128  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  39.04 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  38.86 
 
 		 560 aa  127  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  25.5 
 
 		 940 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 1058 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.23 
 
 		 919 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  27.57 
 
 		 1131 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  24.63 
 
 		 970 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.5 
 
 		 1028 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 1046 aa  121  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>