More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1301 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  100 
 
 
1062 aa  2184    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
1116 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
1129 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
1145 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.93 
 
 
1138 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.81 
 
 
1144 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  36.05 
 
 
835 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  40.32 
 
 
1160 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  43.53 
 
 
1167 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.93 
 
 
1172 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  43.46 
 
 
1167 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  43.03 
 
 
1167 aa  386  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  37.81 
 
 
1147 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  42.22 
 
 
1170 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
1172 aa  383  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  33.64 
 
 
1168 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  43.18 
 
 
1160 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  38.75 
 
 
1170 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  31.91 
 
 
1194 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  40.2 
 
 
829 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  41.73 
 
 
1170 aa  365  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  37.19 
 
 
1136 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  39.61 
 
 
1137 aa  362  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.78 
 
 
1212 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  32.22 
 
 
1131 aa  356  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  41.21 
 
 
1169 aa  354  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  43.24 
 
 
1169 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  35.25 
 
 
964 aa  349  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.81 
 
 
988 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  34.46 
 
 
1170 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.66 
 
 
972 aa  284  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.81 
 
 
941 aa  278  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.81 
 
 
941 aa  278  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
933 aa  270  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.3 
 
 
969 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.56 
 
 
962 aa  265  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.04 
 
 
971 aa  263  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.91 
 
 
969 aa  258  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  29.78 
 
 
1069 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 
1069 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.48 
 
 
966 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
937 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.54 
 
 
801 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  35.51 
 
 
814 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.77 
 
 
805 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  43.71 
 
 
440 aa  233  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
877 aa  231  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.68 
 
 
922 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.1 
 
 
927 aa  224  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.15 
 
 
919 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.3 
 
 
1057 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27.6 
 
 
925 aa  218  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  29.91 
 
 
560 aa  218  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.53 
 
 
560 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.11 
 
 
1165 aa  213  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  29.53 
 
 
560 aa  210  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  32.56 
 
 
1038 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  31 
 
 
952 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  29.16 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  29.16 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  29.16 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  29.16 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  29.16 
 
 
560 aa  208  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  29.35 
 
 
560 aa  208  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  29.35 
 
 
560 aa  207  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.14 
 
 
1201 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.39 
 
 
1045 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
1201 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  40.05 
 
 
906 aa  205  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.63 
 
 
1049 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
948 aa  205  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.6 
 
 
554 aa  204  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.5 
 
 
1031 aa  204  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.5 
 
 
584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.19 
 
 
584 aa  199  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.65 
 
 
964 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
1046 aa  198  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.41 
 
 
963 aa  197  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.02 
 
 
961 aa  195  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.33 
 
 
955 aa  193  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.43 
 
 
1028 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  30.66 
 
 
963 aa  190  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.2 
 
 
1058 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.91 
 
 
915 aa  188  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.49 
 
 
957 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  30.61 
 
 
932 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.7 
 
 
572 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
578 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  29.63 
 
 
929 aa  185  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.55 
 
 
916 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.6 
 
 
951 aa  185  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.21 
 
 
1095 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.55 
 
 
915 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.84 
 
 
1082 aa  184  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.27 
 
 
950 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  30.07 
 
 
966 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  28.57 
 
 
949 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  30.41 
 
 
921 aa  181  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.52 
 
 
933 aa  179  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>