More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1123 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  58.32 
 
 		 814 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.49 
 
 		 1212 aa  1522    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  100 
 
 		 1169 aa  2385    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.28 
 
 		 1170 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  51.5 
 
 		 1194 aa  1112    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  50.21 
 
 		 1168 aa  1100    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  50.8 
 
 		 1172 aa  1144    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  72.03 
 
 		 1170 aa  1765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  54.8 
 
 		 760 aa  821    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  58.99 
 
 		 1170 aa  1349    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  52.3 
 
 		 829 aa  750    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  49.83 
 
 		 1167 aa  1082    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  50 
 
 		 1167 aa  1083    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  44.98 
 
 		 1137 aa  872    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  49.91 
 
 		 1160 aa  1064    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  44.98 
 
 		 1136 aa  870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  63.36 
 
 		 906 aa  1123    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  60.17 
 
 		 1170 aa  1450    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  60.67 
 
 		 1172 aa  1482    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  95.29 
 
 		 1169 aa  2233    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  48.6 
 
 		 1160 aa  1013    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  50.42 
 
 		 1167 aa  1093    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  46.42 
 
 		 774 aa  625  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.41 
 
 		 964 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  63.33 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 1129 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.23 
 
 		 1116 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  32.97 
 
 		 1138 aa  459  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.9 
 
 		 1145 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1144 aa  436  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  55.24 
 
 		 1131 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.44 
 
 		 835 aa  390  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1147 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  40 
 
 		 1062 aa  348  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.52 
 
 		 565 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.71 
 
 		 988 aa  333  8e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  62.18 
 
 		 283 aa  325  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.79 
 
 		 969 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  33.04 
 
 		 877 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.53 
 
 		 1069 aa  268  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 1069 aa  268  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.55 
 
 		 971 aa  257  9e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 933 aa  250  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.9 
 
 		 801 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.06 
 
 		 966 aa  248  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  31.46 
 
 		 962 aa  248  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 941 aa  244  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 941 aa  244  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.83 
 
 		 922 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.47 
 
 		 969 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.8 
 
 		 805 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.63 
 
 		 925 aa  239  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  46.3 
 
 		 312 aa  236  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.14 
 
 		 927 aa  234  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 1046 aa  229  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.71 
 
 		 937 aa  228  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.01 
 
 		 952 aa  228  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.42 
 
 		 972 aa  227  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.34 
 
 		 919 aa  220  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.31 
 
 		 1049 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.21 
 
 		 572 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1031 aa  215  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.03 
 
 		 1045 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.65 
 
 		 894 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 1058 aa  213  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.53 
 
 		 1057 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.86 
 
 		 1165 aa  197  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28.18 
 
 		 560 aa  197  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  28 
 
 		 560 aa  197  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.83 
 
 		 1038 aa  196  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28 
 
 		 560 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.68 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.68 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.68 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.68 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.68 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  28.03 
 
 		 560 aa  194  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.29 
 
 		 1082 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 		 1177 aa  192  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  31.38 
 
 		 963 aa  185  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 986 aa  186  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.77 
 
 		 953 aa  184  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.24 
 
 		 900 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.35 
 
 		 955 aa  179  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.51 
 
 		 1095 aa  178  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.61 
 
 		 1201 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.61 
 
 		 1201 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.21 
 
 		 961 aa  177  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.57 
 
 		 584 aa  177  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.62 
 
 		 961 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.66 
 
 		 951 aa  172  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 		 969 aa  171  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.73 
 
 		 1013 aa  170  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 954 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.9 
 
 		 945 aa  170  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 948 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.2 
 
 		 1028 aa  169  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.53 
 
 		 950 aa  168  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.15 
 
 		 584 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>