More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1271 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  42.36 
 
 		 1082 aa  843    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1177 aa  2407    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  40.11 
 
 		 840 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  33.36 
 
 		 1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 1046 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.98 
 
 		 1045 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.05 
 
 		 1049 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 1058 aa  466  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  33.26 
 
 		 1044 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  33.23 
 
 		 1038 aa  410  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  31.65 
 
 		 1095 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  33.23 
 
 		 1057 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.66 
 
 		 1201 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 1201 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  33.33 
 
 		 1165 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.17 
 
 		 1028 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  40.85 
 
 		 338 aa  211  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.32 
 
 		 969 aa  202  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.49 
 
 		 919 aa  201  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.48 
 
 		 1167 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.95 
 
 		 971 aa  195  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  32.13 
 
 		 1129 aa  195  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  29.97 
 
 		 945 aa  194  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1167 aa  194  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.33 
 
 		 1170 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  29.98 
 
 		 1167 aa  192  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.13 
 
 		 1170 aa  191  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.18 
 
 		 1169 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 1170 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.73 
 
 		 1116 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1169 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.57 
 
 		 988 aa  185  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  29 
 
 		 952 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.16 
 
 		 1212 aa  182  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.35 
 
 		 952 aa  182  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.35 
 
 		 952 aa  182  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 968 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  24.65 
 
 		 957 aa  180  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.31 
 
 		 973 aa  180  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1172 aa  179  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28 
 
 		 952 aa  178  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.03 
 
 		 1160 aa  178  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.1 
 
 		 966 aa  177  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.83 
 
 		 1172 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1144 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 933 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.09 
 
 		 835 aa  176  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 724 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  25.95 
 
 		 953 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.78 
 
 		 1168 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 962 aa  172  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.31 
 
 		 1170 aa  172  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  29.88 
 
 		 1194 aa  171  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.47 
 
 		 941 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.47 
 
 		 969 aa  170  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 969 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 941 aa  168  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 941 aa  168  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.38 
 
 		 950 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1145 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1136 aa  166  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.38 
 
 		 964 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1147 aa  163  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.23 
 
 		 933 aa  161  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.46 
 
 		 829 aa  159  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  26.7 
 
 		 1062 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 		 1137 aa  155  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.36 
 
 		 958 aa  154  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.23 
 
 		 1094 aa  154  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  26.26 
 
 		 972 aa  154  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.01 
 
 		 805 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.27 
 
 		 1138 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 		 877 aa  153  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.45 
 
 		 958 aa  153  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  25.6 
 
 		 801 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.69 
 
 		 900 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 		 923 aa  144  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 937 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.04 
 
 		 925 aa  140  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  25.55 
 
 		 560 aa  138  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.96 
 
 		 894 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.38 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  25.38 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  25.38 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  25.38 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.38 
 
 		 560 aa  136  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  25.38 
 
 		 560 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  25.13 
 
 		 560 aa  135  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  25.34 
 
 		 927 aa  134  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  25.3 
 
 		 560 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.29 
 
 		 964 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.06 
 
 		 963 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.03 
 
 		 1069 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 1069 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 1013 aa  122  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.56 
 
 		 961 aa  121  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  27.26 
 
 		 921 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  27.3 
 
 		 968 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  35.5 
 
 		 948 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>