More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0680 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1167 aa  2372    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  91.24 
 
 
1167 aa  2149    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.06 
 
 
1212 aa  1122    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  92.35 
 
 
1167 aa  2159    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  53.95 
 
 
1172 aa  1211    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  46.9 
 
 
760 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  48.28 
 
 
774 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  51.67 
 
 
829 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  46.23 
 
 
1137 aa  906    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  47.79 
 
 
906 aa  779    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  45.17 
 
 
1136 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  49.16 
 
 
1170 aa  1060    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  53.58 
 
 
1168 aa  1202    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  52.34 
 
 
1170 aa  1145    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  81.05 
 
 
1170 aa  1918    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  50.59 
 
 
1160 aa  1097    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  51.83 
 
 
1170 aa  1176    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  48.73 
 
 
1172 aa  1127    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  49.87 
 
 
1169 aa  1077    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  52.16 
 
 
1194 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  49.83 
 
 
1169 aa  1082    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  57.18 
 
 
1160 aa  1290    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  41.37 
 
 
964 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  48.95 
 
 
814 aa  549  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  61.02 
 
 
440 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.3 
 
 
1129 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.43 
 
 
1116 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.27 
 
 
1138 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
1145 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.01 
 
 
1144 aa  429  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  40.33 
 
 
1131 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
1147 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.36 
 
 
835 aa  396  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  37.47 
 
 
1062 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  38.95 
 
 
565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  68.09 
 
 
283 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28 
 
 
988 aa  312  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.23 
 
 
971 aa  287  9e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.05 
 
 
969 aa  280  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  51.95 
 
 
312 aa  260  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  34.12 
 
 
966 aa  252  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.5 
 
 
925 aa  251  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.06 
 
 
941 aa  250  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.06 
 
 
941 aa  250  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.26 
 
 
1069 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.26 
 
 
1069 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
933 aa  245  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.5 
 
 
969 aa  244  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.61 
 
 
922 aa  244  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.32 
 
 
927 aa  241  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.14 
 
 
801 aa  237  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  31.92 
 
 
962 aa  237  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.65 
 
 
919 aa  236  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.07 
 
 
972 aa  233  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.16 
 
 
805 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.32 
 
 
952 aa  225  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
877 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.95 
 
 
937 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
1031 aa  212  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.97 
 
 
1045 aa  211  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.62 
 
 
894 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 
1058 aa  207  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.89 
 
 
1057 aa  202  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 
1046 aa  202  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
1177 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  32.51 
 
 
1095 aa  192  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.87 
 
 
1049 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.02 
 
 
1082 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.61 
 
 
1028 aa  186  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.06 
 
 
1165 aa  183  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.93 
 
 
1044 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 
900 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.24 
 
 
1201 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 
1201 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
940 aa  171  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.3 
 
 
584 aa  168  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  28.22 
 
 
975 aa  166  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.7 
 
 
961 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.24 
 
 
964 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.97 
 
 
1038 aa  164  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1013 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 
955 aa  162  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.25 
 
 
960 aa  162  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.39 
 
 
1046 aa  161  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.69 
 
 
937 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.36 
 
 
933 aa  160  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.76 
 
 
963 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.88 
 
 
973 aa  159  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.01 
 
 
949 aa  158  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
986 aa  158  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.4 
 
 
921 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  27.33 
 
 
953 aa  156  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.55 
 
 
1094 aa  157  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  26.32 
 
 
951 aa  155  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 
669 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.38 
 
 
945 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
963 aa  154  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 
942 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30 
 
 
915 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>