More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0387 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  100 
 
 
584 aa  1187    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  94.35 
 
 
584 aa  1121    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 
560 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  39.08 
 
 
554 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  39.96 
 
 
560 aa  353  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  38.57 
 
 
555 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  39.19 
 
 
560 aa  347  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  39.19 
 
 
560 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  39.52 
 
 
560 aa  346  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  38.45 
 
 
572 aa  339  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  36.28 
 
 
669 aa  336  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  38.2 
 
 
467 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  36.55 
 
 
578 aa  320  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
942 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  31.66 
 
 
949 aa  232  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
941 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
941 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  30.53 
 
 
951 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
933 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  29.84 
 
 
967 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 
1129 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  32.23 
 
 
921 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  31.3 
 
 
915 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.05 
 
 
988 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  29.12 
 
 
963 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.62 
 
 
916 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.92 
 
 
915 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.75 
 
 
961 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  31.89 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  29.31 
 
 
665 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  30.29 
 
 
932 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 
947 aa  211  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
955 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
1116 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.2 
 
 
963 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  30.66 
 
 
929 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.04 
 
 
966 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.43 
 
 
969 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.99 
 
 
972 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  28.39 
 
 
966 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.08 
 
 
805 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 
877 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.35 
 
 
801 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  29.49 
 
 
960 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.73 
 
 
969 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.89 
 
 
962 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
1147 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 
900 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.62 
 
 
971 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
937 aa  183  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  29.21 
 
 
1043 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.77 
 
 
919 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
964 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.45 
 
 
835 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.81 
 
 
1144 aa  177  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.8 
 
 
1168 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 
1136 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 
1172 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.59 
 
 
894 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.84 
 
 
829 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
1002 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.99 
 
 
1138 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
1167 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
1170 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.1 
 
 
1170 aa  170  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
1167 aa  170  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 
1172 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.96 
 
 
1167 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.94 
 
 
1169 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.58 
 
 
1169 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.54 
 
 
872 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  28.34 
 
 
1170 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
1145 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.73 
 
 
1013 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  26.42 
 
 
1057 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.7 
 
 
1069 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
1069 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.18 
 
 
1037 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.81 
 
 
1160 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.35 
 
 
1045 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.23 
 
 
1160 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  28.37 
 
 
919 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 
968 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.55 
 
 
952 aa  157  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  28.54 
 
 
969 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  27.95 
 
 
968 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  27.95 
 
 
968 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>