More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3539 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  100 
 
 		 872 aa  1786    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 1002 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  37.05 
 
 		 985 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  35.4 
 
 		 1386 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.26 
 
 		 1362 aa  227  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  35.57 
 
 		 1354 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.77 
 
 		 1181 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  35.66 
 
 		 991 aa  213  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.54 
 
 		 1068 aa  211  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 		 1091 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 		 1120 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  34.15 
 
 		 1381 aa  207  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.89 
 
 		 1064 aa  207  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 1403 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1066 aa  206  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  30.49 
 
 		 1087 aa  205  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.58 
 
 		 1134 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 1021 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1088 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.08 
 
 		 1161 aa  204  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  34.06 
 
 		 621 aa  204  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  30.56 
 
 		 1082 aa  203  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1088 aa  203  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  32.89 
 
 		 1159 aa  203  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 		 1449 aa  203  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  34.48 
 
 		 988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 1082 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  32.81 
 
 		 674 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  30.52 
 
 		 1070 aa  202  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.19 
 
 		 977 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 		 950 aa  201  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.23 
 
 		 1064 aa  201  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  29.84 
 
 		 1082 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  29.84 
 
 		 1082 aa  201  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  33.82 
 
 		 1073 aa  200  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.81 
 
 		 1064 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 1069 aa  200  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  32.01 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  32.01 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  32.01 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.79 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  32.01 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.4 
 
 		 1070 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.15 
 
 		 1068 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.22 
 
 		 1071 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 1055 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.13 
 
 		 1110 aa  198  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.85 
 
 		 1084 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  30.87 
 
 		 1064 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  31.85 
 
 		 1025 aa  198  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.52 
 
 		 1062 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.92 
 
 		 1084 aa  197  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 1357 aa  197  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1073 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 1089 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  30.18 
 
 		 1437 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 1073 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 1080 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 1073 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.33 
 
 		 914 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.79 
 
 		 1068 aa  196  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  30.2 
 
 		 1069 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1171 aa  195  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  33.54 
 
 		 918 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  33.79 
 
 		 1178 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.37 
 
 		 1102 aa  194  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 1073 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.39 
 
 		 1084 aa  194  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.19 
 
 		 1091 aa  193  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  31.28 
 
 		 1250 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.59 
 
 		 1284 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.65 
 
 		 1034 aa  193  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  31.66 
 
 		 1120 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  30.85 
 
 		 1069 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  31.52 
 
 		 1120 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 1139 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  29.98 
 
 		 1222 aa  191  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 1112 aa  191  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  31.6 
 
 		 1065 aa  191  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 1129 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.69 
 
 		 1028 aa  191  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1164 aa  191  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.35 
 
 		 1100 aa  190  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.4 
 
 		 1072 aa  190  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.83 
 
 		 1130 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 1068 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.08 
 
 		 648 aa  189  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 922 aa  189  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.43 
 
 		 1111 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.97 
 
 		 1088 aa  187  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  30.2 
 
 		 1394 aa  187  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 1104 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.83 
 
 		 872 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  30.21 
 
 		 522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 1108 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 1090 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 876 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  34.71 
 
 		 896 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.69 
 
 		 959 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  34.22 
 
 		 1150 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>