More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05643 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  100 
 
 
1111 aa  2305    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  48 
 
 
956 aa  869    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  58.79 
 
 
1096 aa  1102    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  44.44 
 
 
1023 aa  754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  61.54 
 
 
860 aa  1048    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.49 
 
 
970 aa  636    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  59.74 
 
 
1222 aa  1181    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  42.27 
 
 
1431 aa  724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  44.59 
 
 
1414 aa  465  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  47.06 
 
 
995 aa  462  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  44.61 
 
 
1558 aa  459  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  43.43 
 
 
522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  44.55 
 
 
1259 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  45.69 
 
 
1566 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  41.05 
 
 
1407 aa  446  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  43.49 
 
 
1519 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  44.42 
 
 
1517 aa  442  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  42.93 
 
 
589 aa  439  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  37.33 
 
 
926 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  41.55 
 
 
509 aa  390  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  42.32 
 
 
479 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  43.34 
 
 
1156 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  40.33 
 
 
663 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  42.53 
 
 
495 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  39.07 
 
 
1326 aa  344  5.999999999999999e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
1112 aa  318  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.76 
 
 
1443 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.42 
 
 
1071 aa  301  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
1069 aa  300  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.6 
 
 
1077 aa  298  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 
1091 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  37.71 
 
 
1107 aa  291  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.76 
 
 
1080 aa  291  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.79 
 
 
1904 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  35.15 
 
 
939 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.92 
 
 
1068 aa  290  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.17 
 
 
1087 aa  289  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.66 
 
 
777 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 
1139 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  35.85 
 
 
609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  36.6 
 
 
1068 aa  288  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  35.18 
 
 
1070 aa  287  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
1104 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.4 
 
 
1067 aa  284  7.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
1082 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  36.15 
 
 
1088 aa  283  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  36.36 
 
 
1088 aa  282  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.04 
 
 
1848 aa  282  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.73 
 
 
1178 aa  282  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.97 
 
 
1161 aa  280  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
1108 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.73 
 
 
1134 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
1068 aa  279  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.53 
 
 
985 aa  278  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  33.69 
 
 
1093 aa  278  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
1073 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  33.83 
 
 
1901 aa  275  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
1021 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
1055 aa  275  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  34.26 
 
 
1084 aa  275  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.08 
 
 
1073 aa  274  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.19 
 
 
1125 aa  274  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
1120 aa  274  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.83 
 
 
1062 aa  273  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.95 
 
 
1193 aa  273  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  35.08 
 
 
1073 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  37.16 
 
 
531 aa  273  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  34.26 
 
 
1084 aa  273  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.81 
 
 
1070 aa  273  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  34.61 
 
 
621 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
1073 aa  273  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.76 
 
 
1181 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
1171 aa  272  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.13 
 
 
1082 aa  272  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
1090 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  36.12 
 
 
872 aa  271  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
1155 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  34.92 
 
 
1086 aa  271  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
1105 aa  271  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  33.94 
 
 
1082 aa  271  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
1112 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  34.23 
 
 
648 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.84 
 
 
1072 aa  270  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
1105 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 
1073 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  33.8 
 
 
1082 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  34.43 
 
 
663 aa  270  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  35.19 
 
 
711 aa  268  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  33.94 
 
 
1082 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  33.68 
 
 
666 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.04 
 
 
1100 aa  268  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.69 
 
 
1048 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.95 
 
 
773 aa  268  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  33.2 
 
 
1150 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  34.02 
 
 
1113 aa  267  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
1113 aa  267  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  34.75 
 
 
1086 aa  266  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.19 
 
 
1091 aa  266  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.27 
 
 
977 aa  266  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
876 aa  265  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>