More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90641 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  100 
 
 		 1414 aa  2909    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  42.3 
 
 		 1517 aa  975    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  41.09 
 
 		 1519 aa  920    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  44.79 
 
 		 1111 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  41.94 
 
 		 1222 aa  466  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  43.63 
 
 		 956 aa  460  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  45.44 
 
 		 1096 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  44.38 
 
 		 1431 aa  449  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  44.76 
 
 		 1407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  43.95 
 
 		 1566 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  41.3 
 
 		 970 aa  436  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  42.5 
 
 		 1259 aa  426  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  44.27 
 
 		 1023 aa  423  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  43.91 
 
 		 995 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.17 
 
 		 860 aa  413  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  40.36 
 
 		 1558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  45.11 
 
 		 479 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  36.07 
 
 		 663 aa  393  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.65 
 
 		 1326 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  43.58 
 
 		 495 aa  383  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  40.82 
 
 		 522 aa  376  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.96 
 
 		 1443 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  37.84 
 
 		 589 aa  367  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  38.73 
 
 		 509 aa  327  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  37.89 
 
 		 531 aa  322  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  38.81 
 
 		 1156 aa  322  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  35.37 
 
 		 1107 aa  286  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 		 1112 aa  284  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  34.57 
 
 		 1093 aa  271  5.9999999999999995e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  33.01 
 
 		 1769 aa  267  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  33.46 
 
 		 1901 aa  267  8.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  32.12 
 
 		 1067 aa  266  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.7 
 
 		 1904 aa  265  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 1082 aa  264  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.33 
 
 		 1848 aa  264  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.55 
 
 		 1068 aa  262  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  31.84 
 
 		 1193 aa  259  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  31.92 
 
 		 939 aa  259  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.93 
 
 		 1068 aa  258  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.85 
 
 		 1134 aa  256  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.21 
 
 		 1071 aa  254  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  34.45 
 
 		 663 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 1069 aa  251  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.1 
 
 		 1077 aa  251  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 		 1091 aa  250  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  34.03 
 
 		 773 aa  251  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1088 aa  248  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1088 aa  248  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  32.04 
 
 		 711 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  34.72 
 
 		 1070 aa  246  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 1108 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.19 
 
 		 1125 aa  244  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  30.67 
 
 		 1159 aa  243  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  33.26 
 
 		 1032 aa  244  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.73 
 
 		 991 aa  244  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  33.03 
 
 		 609 aa  244  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  34.37 
 
 		 1088 aa  243  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  30.89 
 
 		 964 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.98 
 
 		 1087 aa  242  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 982 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  31.35 
 
 		 821 aa  241  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.45 
 
 		 1100 aa  240  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  32.92 
 
 		 1150 aa  240  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.49 
 
 		 777 aa  240  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 1068 aa  239  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.4 
 
 		 1070 aa  239  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.75 
 
 		 1091 aa  238  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.75 
 
 		 977 aa  239  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1129 aa  239  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 1155 aa  238  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  32.56 
 
 		 1113 aa  237  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 1113 aa  237  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 1120 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  33.47 
 
 		 1080 aa  236  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1105 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  31.3 
 
 		 1031 aa  236  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.98 
 
 		 985 aa  236  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1068 aa  236  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  32.52 
 
 		 545 aa  235  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  31.51 
 
 		 980 aa  235  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  32.65 
 
 		 1082 aa  234  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 876 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.19 
 
 		 1181 aa  233  1e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.5 
 
 		 914 aa  234  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 1112 aa  234  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.5 
 
 		 918 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  31.73 
 
 		 1003 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  32.84 
 
 		 1437 aa  233  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.84 
 
 		 666 aa  233  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 		 1021 aa  233  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.82 
 
 		 1143 aa  232  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  32.29 
 
 		 1112 aa  232  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 1090 aa  232  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.48 
 
 		 1086 aa  232  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.19 
 
 		 872 aa  232  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.45 
 
 		 1082 aa  231  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.96 
 
 		 1386 aa  231  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  32.45 
 
 		 1082 aa  231  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.26 
 
 		 1139 aa  231  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1357 aa  231  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>