More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54139 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.7 
 
 		 1407 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1558 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  46.94 
 
 		 1566 aa  646    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  100 
 
 		 995 aa  2064    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  48.25 
 
 		 1259 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  47.84 
 
 		 1431 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  42.39 
 
 		 956 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  47.47 
 
 		 1222 aa  475  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  47.06 
 
 		 1111 aa  461  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  45.68 
 
 		 1096 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  46.8 
 
 		 1023 aa  440  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  43.92 
 
 		 970 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  35.27 
 
 		 1156 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.28 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  41.7 
 
 		 1519 aa  416  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.91 
 
 		 1414 aa  416  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.69 
 
 		 860 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  41.6 
 
 		 1517 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  43.41 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  42.3 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  39.27 
 
 		 663 aa  354  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  40.76 
 
 		 495 aa  351  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  38.64 
 
 		 1443 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  40.72 
 
 		 479 aa  337  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  35.59 
 
 		 1093 aa  309  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 		 1112 aa  307  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.82 
 
 		 1326 aa  307  8.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  36.32 
 
 		 1107 aa  303  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  35.94 
 
 		 1848 aa  301  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  36.4 
 
 		 1067 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.4 
 
 		 1077 aa  296  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.63 
 
 		 1904 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 		 1139 aa  290  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.94 
 
 		 1193 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.46 
 
 		 1901 aa  287  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.21 
 
 		 939 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.23 
 
 		 1125 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.92 
 
 		 1087 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  34.22 
 
 		 1769 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  44.68 
 
 		 1612 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  36 
 
 		 1062 aa  272  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 1082 aa  271  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  43.4 
 
 		 1698 aa  271  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.63 
 
 		 711 aa  268  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  43.77 
 
 		 1765 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  33.4 
 
 		 1178 aa  266  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1088 aa  265  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  36.99 
 
 		 773 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 1104 aa  264  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 		 1029 aa  264  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1050 aa  264  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  36.66 
 
 		 531 aa  264  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 1073 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  33.06 
 
 		 1072 aa  263  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.86 
 
 		 1088 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.19 
 
 		 1068 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1362 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 1091 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.96 
 
 		 663 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 933 aa  262  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 		 1073 aa  261  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1073 aa  260  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.94 
 
 		 1071 aa  260  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  32.59 
 
 		 1386 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  34.17 
 
 		 1069 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  35.11 
 
 		 1013 aa  260  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.88 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1357 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 1069 aa  259  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 		 1073 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1074 aa  258  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 1028 aa  258  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  34.17 
 
 		 1069 aa  258  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  33.82 
 
 		 1354 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 		 1047 aa  258  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  34.06 
 
 		 1120 aa  257  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  35.54 
 
 		 1047 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 876 aa  257  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  42.38 
 
 		 1269 aa  257  7e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 1108 aa  257  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 		 1403 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  33.86 
 
 		 1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  32.44 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  36.29 
 
 		 1100 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.31 
 
 		 1134 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  45.94 
 
 		 868 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.47 
 
 		 1181 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 		 1069 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 		 1112 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  34.08 
 
 		 1031 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  41.35 
 
 		 1053 aa  254  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.33 
 
 		 1070 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.22 
 
 		 1082 aa  254  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.66 
 
 		 1250 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.49 
 
 		 1068 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.81 
 
 		 918 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  32.15 
 
 		 1437 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 1068 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.75 
 
 		 918 aa  253  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 		 1048 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>