More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119553 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  48.12 
 
 		 1557 aa  639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  100 
 
 		 1053 aa  2199    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  57.28 
 
 		 1698 aa  396  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  57.28 
 
 		 1246 aa  392  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  60.89 
 
 		 248 aa  329  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  41.64 
 
 		 1612 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  41.43 
 
 		 1269 aa  302  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  42.44 
 
 		 1765 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  43.33 
 
 		 956 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  41.5 
 
 		 1407 aa  265  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  41.35 
 
 		 995 aa  254  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1558 aa  254  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  41.64 
 
 		 1023 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  39.09 
 
 		 1566 aa  251  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  41.04 
 
 		 1111 aa  250  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  42.11 
 
 		 1096 aa  249  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  40.98 
 
 		 1259 aa  248  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.04 
 
 		 589 aa  245  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  38.89 
 
 		 1431 aa  237  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  41.64 
 
 		 1222 aa  235  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  38.89 
 
 		 970 aa  234  7.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  40.67 
 
 		 868 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  39.37 
 
 		 926 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  40.85 
 
 		 1156 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  40.51 
 
 		 860 aa  214  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 1414 aa  214  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 832 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  38.85 
 
 		 1519 aa  212  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12368  predicted protein  76.19 
 
 		 126 aa  208  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  40.19 
 
 		 509 aa  207  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  37.54 
 
 		 1093 aa  204  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  37.9 
 
 		 522 aa  200  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  37.93 
 
 		 479 aa  200  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 		 966 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  37.33 
 
 		 621 aa  199  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.77 
 
 		 977 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.04 
 
 		 1087 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 1129 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.22 
 
 		 1125 aa  191  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  36.36 
 
 		 1517 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  35.81 
 
 		 1031 aa  189  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 		 1082 aa  189  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 1112 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  37.07 
 
 		 1072 aa  184  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  35.52 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  35.86 
 
 		 1100 aa  184  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.09 
 
 		 1077 aa  183  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  37.13 
 
 		 495 aa  182  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  36.62 
 
 		 1209 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  36.96 
 
 		 1181 aa  181  4e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  35.17 
 
 		 1901 aa  181  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 		 1047 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 		 1048 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  36.16 
 
 		 1047 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 950 aa  181  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 985 aa  181  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.86 
 
 		 1082 aa  180  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 		 982 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  35.28 
 
 		 663 aa  180  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.1 
 
 		 1134 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 1161 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  36.96 
 
 		 1062 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  36 
 
 		 1068 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.59 
 
 		 1904 aa  179  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  35.78 
 
 		 886 aa  178  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  34.01 
 
 		 1048 aa  178  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  35.09 
 
 		 1088 aa  178  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  36.08 
 
 		 1848 aa  177  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.11 
 
 		 959 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  35.93 
 
 		 1107 aa  177  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 		 1110 aa  177  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  35.37 
 
 		 1003 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  36.73 
 
 		 1078 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 1091 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  35 
 
 		 891 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  32.56 
 
 		 1127 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 		 1069 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 1071 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.88 
 
 		 1068 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  36.64 
 
 		 939 aa  174  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  36.3 
 
 		 1019 aa  175  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 1112 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.7 
 
 		 1084 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 1139 aa  174  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 617 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 		 1089 aa  174  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.23 
 
 		 1130 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  36.3 
 
 		 991 aa  172  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 1386 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  36.04 
 
 		 1006 aa  172  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  35.74 
 
 		 1070 aa  172  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 1362 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 933 aa  171  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 1090 aa  171  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 		 1068 aa  171  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.55 
 
 		 1102 aa  171  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1088 aa  171  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1088 aa  170  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 		 1155 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  31.19 
 
 		 901 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>