More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33727 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1698    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  37.32 
 
 
926 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  39.63 
 
 
868 aa  469  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  46.33 
 
 
509 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  45.77 
 
 
589 aa  273  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  49.3 
 
 
1566 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  47.89 
 
 
1558 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  47.21 
 
 
1023 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  49.3 
 
 
1407 aa  257  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  38.21 
 
 
1111 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  44.25 
 
 
1222 aa  255  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  43.38 
 
 
1431 aa  255  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  46.37 
 
 
1259 aa  252  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  43.53 
 
 
956 aa  252  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  42.55 
 
 
1096 aa  250  8e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  45.2 
 
 
995 aa  248  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  42.16 
 
 
970 aa  247  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  45.15 
 
 
1156 aa  237  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  32.31 
 
 
609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  40.06 
 
 
1557 aa  223  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  40.21 
 
 
1765 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  33.33 
 
 
1612 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  38.71 
 
 
1053 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  38.37 
 
 
1698 aa  218  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.36 
 
 
1414 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  39.44 
 
 
1519 aa  213  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  33.66 
 
 
1269 aa  211  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.45 
 
 
860 aa  203  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  39.19 
 
 
522 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  41.06 
 
 
248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 
1246 aa  195  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  37.02 
 
 
479 aa  189  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04120  Pol II transcription elongation factor, putative  36.23 
 
 
902 aa  189  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  41.79 
 
 
1107 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  37.38 
 
 
939 aa  183  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
1047 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  36.69 
 
 
1047 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  36.45 
 
 
1443 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  36.96 
 
 
663 aa  177  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
1112 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  35.52 
 
 
1072 aa  174  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  44.78 
 
 
1517 aa  173  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  34.75 
 
 
495 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  39.56 
 
 
1093 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.27 
 
 
1068 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
1048 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.8 
 
 
1062 aa  171  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.54 
 
 
1078 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.41 
 
 
1082 aa  169  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  34.97 
 
 
621 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  35.82 
 
 
1901 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.01 
 
 
1077 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  35.59 
 
 
1904 aa  167  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.38 
 
 
1080 aa  167  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.62 
 
 
1134 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  32.64 
 
 
531 aa  165  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
1082 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.89 
 
 
1031 aa  164  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  29.8 
 
 
1019 aa  164  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
1089 aa  163  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  32.55 
 
 
980 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.17 
 
 
1068 aa  163  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  32.48 
 
 
1154 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
1108 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  34.56 
 
 
1081 aa  161  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  33.46 
 
 
777 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
1112 aa  160  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
1105 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.58 
 
 
1227 aa  160  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.22 
 
 
773 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  33.22 
 
 
666 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
1105 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  32.09 
 
 
958 aa  160  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.78 
 
 
1071 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  31.33 
 
 
1067 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
1050 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
1069 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.33 
 
 
1848 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.15 
 
 
1088 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  35.87 
 
 
918 aa  158  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  32.73 
 
 
1163 aa  158  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
1074 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.15 
 
 
1088 aa  158  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.22 
 
 
663 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
1091 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  36.06 
 
 
1181 aa  157  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  35.69 
 
 
1084 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  33.71 
 
 
1161 aa  157  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  43 
 
 
1326 aa  157  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
1120 aa  157  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  33.81 
 
 
535 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  35.87 
 
 
918 aa  157  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
876 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.96 
 
 
1087 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.82 
 
 
964 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
1110 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.94 
 
 
1125 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  33.57 
 
 
1354 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  31.99 
 
 
914 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
950 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>