More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6255 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  46.86 
 
 		 1013 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 		 1074 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 		 1048 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  50.65 
 
 		 1050 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  41.37 
 
 		 1078 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  42.33 
 
 		 1006 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  100 
 
 		 1019 aa  2003    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  40.68 
 
 		 1072 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 1047 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  40.69 
 
 		 1047 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 		 1112 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 		 1007 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  45.03 
 
 		 990 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  41.2 
 
 		 1007 aa  612  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  45.47 
 
 		 1019 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.71 
 
 		 1067 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  40.92 
 
 		 1065 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 		 933 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  40.62 
 
 		 1063 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  59.47 
 
 		 1028 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.71 
 
 		 1099 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  41.62 
 
 		 1040 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  47.66 
 
 		 1033 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.83 
 
 		 925 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  43.31 
 
 		 924 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.39 
 
 		 1029 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.53 
 
 		 918 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  38.5 
 
 		 918 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.56 
 
 		 918 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.43 
 
 		 918 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  41.8 
 
 		 918 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.43 
 
 		 918 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.43 
 
 		 918 aa  529  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.43 
 
 		 918 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.43 
 
 		 918 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 		 918 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  41.36 
 
 		 918 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  53.9 
 
 		 621 aa  519  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  39.94 
 
 		 1175 aa  514  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  43.01 
 
 		 980 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  44.4 
 
 		 958 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  45.58 
 
 		 1185 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  37.72 
 
 		 886 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  36.14 
 
 		 1048 aa  502  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  52.06 
 
 		 1531 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  43.32 
 
 		 988 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  45.88 
 
 		 903 aa  483  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 		 1152 aa  469  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  41.88 
 
 		 902 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  48.6 
 
 		 1026 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  42.35 
 
 		 949 aa  459  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  45.62 
 
 		 892 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  45.44 
 
 		 898 aa  452  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  41.89 
 
 		 899 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  41.36 
 
 		 917 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  43.06 
 
 		 901 aa  432  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  50.63 
 
 		 617 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  37.58 
 
 		 1194 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 		 931 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.42 
 
 		 1087 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 		 895 aa  402  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41 
 
 		 1082 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 		 1021 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  44.03 
 
 		 977 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  35.95 
 
 		 1139 aa  370  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 		 1055 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 		 982 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 1112 aa  363  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  42.02 
 
 		 1362 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.63 
 
 		 1091 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.23 
 
 		 1125 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.94 
 
 		 1112 aa  355  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  42.54 
 
 		 1071 aa  355  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  42.02 
 
 		 1386 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 		 1139 aa  353  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  41.98 
 
 		 1068 aa  352  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.4 
 
 		 964 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.2 
 
 		 1077 aa  349  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 		 1108 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 		 1069 aa  347  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 		 1403 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 		 1068 aa  345  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.94 
 
 		 1068 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  38.84 
 
 		 1354 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  43.75 
 
 		 1062 aa  344  5e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.39 
 
 		 1082 aa  343  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  35.37 
 
 		 1031 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 1003 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  40.29 
 
 		 1084 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 1129 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  45.04 
 
 		 663 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.43 
 
 		 914 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.97 
 
 		 1091 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.98 
 
 		 918 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  41.61 
 
 		 1134 aa  337  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.06 
 
 		 773 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 		 1261 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  38.8 
 
 		 1088 aa  336  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.53 
 
 		 1102 aa  335  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 		 1069 aa  334  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>