More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3286 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  50.97 
 
 		 958 aa  853    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  100 
 
 		 988 aa  1955    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.59 
 
 		 1029 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  47.56 
 
 		 1050 aa  562  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  42.84 
 
 		 1013 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  48.7 
 
 		 1074 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.64 
 
 		 1026 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  41.13 
 
 		 990 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  47.55 
 
 		 1033 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  39.35 
 
 		 1072 aa  521  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 1047 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  39.47 
 
 		 1078 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  41.95 
 
 		 1047 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 		 1048 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.34 
 
 		 1028 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  38.97 
 
 		 1040 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  42.6 
 
 		 1006 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 		 1112 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.63 
 
 		 1019 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  39.12 
 
 		 1007 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  41.36 
 
 		 924 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  43.96 
 
 		 1019 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 		 925 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  39.58 
 
 		 886 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  36.79 
 
 		 1175 aa  471  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 		 1007 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  39.58 
 
 		 980 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  41.52 
 
 		 1048 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.94 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  43.95 
 
 		 1065 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.21 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.21 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.21 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.21 
 
 		 918 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.21 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 918 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.21 
 
 		 918 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.06 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.06 
 
 		 918 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.06 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 		 918 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 1152 aa  449  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.55 
 
 		 1067 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  44.19 
 
 		 1063 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  50.21 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  43.59 
 
 		 1099 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  40.35 
 
 		 949 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  36.15 
 
 		 1194 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  40 
 
 		 1185 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  42.18 
 
 		 903 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  43.15 
 
 		 1531 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  41.31 
 
 		 901 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 898 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  38.59 
 
 		 902 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 		 617 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 		 892 aa  376  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  37.88 
 
 		 899 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  39.07 
 
 		 917 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 895 aa  360  6e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  41.4 
 
 		 931 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.83 
 
 		 1077 aa  348  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 1082 aa  346  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.59 
 
 		 1087 aa  346  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 		 1112 aa  340  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  37.21 
 
 		 1062 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.07 
 
 		 1068 aa  334  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 982 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 		 1055 aa  331  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.75 
 
 		 1068 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 1069 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.66 
 
 		 1086 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  38.61 
 
 		 1071 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.74 
 
 		 1209 aa  327  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  41.94 
 
 		 985 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.82 
 
 		 1125 aa  323  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.37 
 
 		 1082 aa  321  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 		 1068 aa  321  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 		 1021 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 1110 aa  320  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.16 
 
 		 964 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.53 
 
 		 1091 aa  320  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  39.09 
 
 		 1178 aa  318  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.72 
 
 		 1102 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  37.3 
 
 		 1161 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.98 
 
 		 777 aa  314  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  42.24 
 
 		 1126 aa  314  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.27 
 
 		 977 aa  314  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  40.8 
 
 		 1025 aa  313  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 1090 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 		 876 aa  312  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.17 
 
 		 1357 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 		 1068 aa  312  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.47 
 
 		 1003 aa  312  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.21 
 
 		 991 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  42.15 
 
 		 1086 aa  311  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  39.48 
 
 		 1150 aa  311  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 1073 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 		 1104 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  40.4 
 
 		 1100 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  40.5 
 
 		 1164 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>