More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3458 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 		 1069 aa  727    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.14 
 
 		 1125 aa  647    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.54 
 
 		 1082 aa  931    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 		 1112 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  35.65 
 
 		 1064 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  35.41 
 
 		 1064 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  35.5 
 
 		 1064 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  35.6 
 
 		 1064 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  35.62 
 
 		 1064 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 		 1068 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 		 1066 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  35.6 
 
 		 1064 aa  685    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  100 
 
 		 1077 aa  2210    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  35.5 
 
 		 1064 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  35.69 
 
 		 1064 aa  673    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.11 
 
 		 1084 aa  731    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  35.62 
 
 		 1064 aa  678    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  46.8 
 
 		 1087 aa  1008    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  36.42 
 
 		 1084 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  36.67 
 
 		 1084 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 1139 aa  592  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.05 
 
 		 1102 aa  551  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.78 
 
 		 1082 aa  547  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  40.28 
 
 		 1031 aa  539  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 		 1089 aa  519  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.99 
 
 		 1069 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.96 
 
 		 1069 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.41 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.1 
 
 		 1068 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 1069 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  36.37 
 
 		 1394 aa  469  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  37.35 
 
 		 1071 aa  465  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.55 
 
 		 1068 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  38.23 
 
 		 1181 aa  457  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 		 1091 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 1068 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.04 
 
 		 977 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  44.12 
 
 		 1086 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 1357 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 1021 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.06 
 
 		 1031 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 1055 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 1068 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 		 982 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  30.63 
 
 		 1032 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 1129 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.69 
 
 		 1108 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  44.29 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.4 
 
 		 1104 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 		 1105 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 		 1105 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  45.91 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  42.59 
 
 		 964 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  46.12 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  41.27 
 
 		 918 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  36.96 
 
 		 1062 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.68 
 
 		 907 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 		 1113 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.17 
 
 		 773 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  45.26 
 
 		 1091 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.33 
 
 		 1362 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  45.11 
 
 		 1113 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.96 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 1155 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 918 aa  393  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  44.3 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.9 
 
 		 1178 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 1386 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.42 
 
 		 918 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.58 
 
 		 918 aa  389  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  41.39 
 
 		 1134 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.58 
 
 		 918 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.42 
 
 		 918 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.42 
 
 		 918 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.58 
 
 		 918 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.58 
 
 		 918 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  41.06 
 
 		 1003 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  40.1 
 
 		 918 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  38.25 
 
 		 1150 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.72 
 
 		 1088 aa  386  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.94 
 
 		 918 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  44.02 
 
 		 876 aa  386  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  45.69 
 
 		 1080 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  44.79 
 
 		 1086 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.82 
 
 		 1088 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.4 
 
 		 1088 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.2 
 
 		 872 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  39.27 
 
 		 1437 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  42.92 
 
 		 1250 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  42.91 
 
 		 621 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.55 
 
 		 1070 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 1066 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  44.49 
 
 		 1100 aa  380  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.56 
 
 		 1073 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  41.7 
 
 		 959 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  45.63 
 
 		 1209 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.35 
 
 		 1163 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 1118 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 933 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>