More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2408 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.99 
 
 		 1143 aa  726    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.49 
 
 		 1110 aa  681    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  41.88 
 
 		 1141 aa  729    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  43.57 
 
 		 1096 aa  779    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  40.02 
 
 		 1159 aa  717    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  100 
 
 		 1163 aa  2349    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.51 
 
 		 1102 aa  728    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.81 
 
 		 1160 aa  949    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  45.98 
 
 		 1154 aa  942    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  49.32 
 
 		 1227 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.63 
 
 		 1081 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 1118 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.2 
 
 		 1086 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.16 
 
 		 964 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 1091 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.09 
 
 		 1071 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.81 
 
 		 1068 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.03 
 
 		 1082 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 		 1069 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 		 1055 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  36.49 
 
 		 1250 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.29 
 
 		 1068 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 1112 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 1261 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.26 
 
 		 1087 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 1171 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 1021 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.35 
 
 		 1077 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 1068 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  36.65 
 
 		 1112 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 		 1104 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.17 
 
 		 1062 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 1068 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  38.72 
 
 		 1088 aa  370  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  39.9 
 
 		 1209 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 		 1120 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  37.65 
 
 		 1070 aa  363  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 		 1066 aa  363  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  39.81 
 
 		 876 aa  363  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 		 1139 aa  363  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.95 
 
 		 1129 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  45.55 
 
 		 872 aa  362  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 1073 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  39.45 
 
 		 1178 aa  360  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.35 
 
 		 1080 aa  359  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 		 982 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  39.97 
 
 		 896 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.38 
 
 		 1134 aa  358  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 1073 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.93 
 
 		 1362 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 1073 aa  357  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  37.38 
 
 		 1070 aa  356  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.1 
 
 		 1386 aa  356  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.66 
 
 		 1091 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  37.42 
 
 		 1082 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 1073 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  37.58 
 
 		 1082 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  35.81 
 
 		 1003 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  35.31 
 
 		 959 aa  355  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  37.58 
 
 		 1082 aa  355  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  45.93 
 
 		 985 aa  354  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.14 
 
 		 1125 aa  354  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 1108 aa  354  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1088 aa  353  8e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  38.88 
 
 		 777 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  36.94 
 
 		 914 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  36.94 
 
 		 918 aa  352  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 		 1403 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.63 
 
 		 1073 aa  352  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.07 
 
 		 773 aa  351  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.86 
 
 		 663 aa  351  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1088 aa  350  8e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.14 
 
 		 1130 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 1155 aa  349  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.92 
 
 		 1357 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.73 
 
 		 977 aa  349  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 1113 aa  348  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  39.02 
 
 		 1113 aa  348  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  39.87 
 
 		 1126 aa  347  8e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  37.36 
 
 		 1150 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  39.38 
 
 		 666 aa  344  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  37.15 
 
 		 1064 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  37.15 
 
 		 1064 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  37.15 
 
 		 1064 aa  344  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  37.15 
 
 		 1064 aa  343  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  40.55 
 
 		 1127 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  37.15 
 
 		 1064 aa  343  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 		 1449 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 1105 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.52 
 
 		 1084 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  36.81 
 
 		 1064 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 1068 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  36.98 
 
 		 1084 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  37.78 
 
 		 1084 aa  341  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  37.06 
 
 		 1064 aa  341  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  36.26 
 
 		 1064 aa  341  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  37.06 
 
 		 1064 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 		 1066 aa  340  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  41 
 
 		 1181 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 1164 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>