More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 		 907 aa  1884    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.08 
 
 		 1102 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.25 
 
 		 1082 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 		 1089 aa  517  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  42.81 
 
 		 1394 aa  482  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 1112 aa  426  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.83 
 
 		 1077 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.23 
 
 		 1087 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 		 1139 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 		 1069 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 1082 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.28 
 
 		 1125 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.03 
 
 		 1084 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  34.36 
 
 		 1064 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  34.36 
 
 		 1064 aa  366  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  30.69 
 
 		 1069 aa  366  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  30.51 
 
 		 1069 aa  361  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  35.61 
 
 		 1064 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  35.61 
 
 		 1064 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  35.61 
 
 		 1064 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  35.61 
 
 		 1064 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  35.61 
 
 		 1064 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  35.09 
 
 		 1064 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 1066 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 1068 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.35 
 
 		 1084 aa  351  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  35.09 
 
 		 1064 aa  351  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.21 
 
 		 1084 aa  348  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.27 
 
 		 1086 aa  341  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  37.92 
 
 		 914 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  37.5 
 
 		 918 aa  334  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.18 
 
 		 977 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  36.4 
 
 		 1080 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  39.71 
 
 		 1357 aa  330  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 1069 aa  327  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.99 
 
 		 1068 aa  327  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.95 
 
 		 1031 aa  323  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.98 
 
 		 1071 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 1091 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.58 
 
 		 1068 aa  321  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  31.28 
 
 		 1032 aa  320  7.999999999999999e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 1108 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 1068 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 1055 aa  314  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  35.62 
 
 		 1181 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  36.38 
 
 		 896 aa  314  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.47 
 
 		 1104 aa  313  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.89 
 
 		 1127 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 		 1403 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.47 
 
 		 982 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  37.76 
 
 		 663 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  34.64 
 
 		 1003 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  37.31 
 
 		 1070 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.69 
 
 		 1100 aa  306  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  37.34 
 
 		 666 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  34.43 
 
 		 1284 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 		 1105 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 1068 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.75 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  37.55 
 
 		 773 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  36.89 
 
 		 1091 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  37.15 
 
 		 1113 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.15 
 
 		 1113 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.63 
 
 		 1025 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.05 
 
 		 1362 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 1261 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.58 
 
 		 1386 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 1105 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  36.2 
 
 		 1112 aa  303  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  35.1 
 
 		 1381 aa  303  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  38.87 
 
 		 777 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 		 1171 aa  303  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  38.94 
 
 		 621 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.38 
 
 		 1088 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 1155 aa  301  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 950 aa  301  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  36.25 
 
 		 991 aa  300  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.08 
 
 		 964 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  36.65 
 
 		 1073 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 		 1021 aa  299  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 1129 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  37.42 
 
 		 985 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  37.07 
 
 		 1048 aa  298  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  35.97 
 
 		 1150 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 		 1449 aa  298  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  36.44 
 
 		 872 aa  297  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  37.16 
 
 		 1082 aa  298  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 		 876 aa  297  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.36 
 
 		 1034 aa  297  7e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 1073 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  38.39 
 
 		 1082 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  36.77 
 
 		 1070 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 1073 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  36.88 
 
 		 1126 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  38.39 
 
 		 1082 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  35.36 
 
 		 1250 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.81 
 
 		 1178 aa  293  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 1073 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 1073 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 		 1118 aa  292  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>