More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2599 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 1449 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  45.86 
 
 		 1357 aa  736    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 		 1403 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  40.24 
 
 		 1354 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.71 
 
 		 1386 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  39.84 
 
 		 1362 aa  836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  100 
 
 		 1437 aa  2964    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  39.51 
 
 		 988 aa  625  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  38.6 
 
 		 1381 aa  609  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  38.05 
 
 		 1025 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  35.71 
 
 		 1284 aa  495  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 		 1112 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 1139 aa  403  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 		 1068 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 1055 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.16 
 
 		 1087 aa  396  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 1021 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.27 
 
 		 1077 aa  387  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  44.51 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  40.88 
 
 		 1073 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  44.51 
 
 		 1073 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.36 
 
 		 1003 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  44.72 
 
 		 1073 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  43.83 
 
 		 985 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 		 982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.05 
 
 		 1070 aa  383  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 		 1082 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  44.26 
 
 		 1108 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 		 1073 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  44.54 
 
 		 1070 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  39.88 
 
 		 1084 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  39.26 
 
 		 1084 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 		 1105 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  42.22 
 
 		 1125 aa  373  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.22 
 
 		 1104 aa  373  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  44.61 
 
 		 1082 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  44.19 
 
 		 1082 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  44.61 
 
 		 1082 aa  373  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  40.53 
 
 		 1161 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 		 1066 aa  370  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 		 876 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  43.08 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1088 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  43 
 
 		 1088 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.01 
 
 		 977 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 		 1105 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1088 aa  366  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.07 
 
 		 1086 aa  365  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 		 1118 aa  364  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  42.53 
 
 		 1209 aa  363  9e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  41.51 
 
 		 1069 aa  363  9e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 1120 aa  363  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.34 
 
 		 964 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.17 
 
 		 777 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  38.08 
 
 		 1112 aa  362  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  41.51 
 
 		 1069 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  45.04 
 
 		 872 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.45 
 
 		 1129 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  37.4 
 
 		 914 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1261 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  33.89 
 
 		 1080 aa  359  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  41.38 
 
 		 1394 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  36.71 
 
 		 1062 aa  358  5e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.38 
 
 		 663 aa  358  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  43.42 
 
 		 1127 aa  358  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.51 
 
 		 1130 aa  357  8.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  37.38 
 
 		 918 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  43.44 
 
 		 773 aa  356  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.67 
 
 		 1068 aa  356  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.02 
 
 		 1102 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.68 
 
 		 1068 aa  355  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 1069 aa  355  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 1091 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  42.65 
 
 		 896 aa  353  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  36.89 
 
 		 1142 aa  351  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  39.39 
 
 		 1064 aa  351  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  350  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.91 
 
 		 1071 aa  350  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 1090 aa  350  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  42.95 
 
 		 1181 aa  348  3e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  41.96 
 
 		 959 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.08 
 
 		 1082 aa  348  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  37.9 
 
 		 1072 aa  348  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 		 1155 aa  348  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.18 
 
 		 991 aa  348  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 903 aa  347  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  347  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  347  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.7 
 
 		 918 aa  347  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  347  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.7 
 
 		 918 aa  347  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  41.24 
 
 		 918 aa  347  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  347  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.7 
 
 		 918 aa  347  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.7 
 
 		 918 aa  347  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 1089 aa  347  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  38.79 
 
 		 1064 aa  346  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.37 
 
 		 1134 aa  346  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  39.19 
 
 		 1064 aa  346  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.7 
 
 		 918 aa  346  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>