More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2916 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1449 aa  2865    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.4 
 
 		 1386 aa  697    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  53.61 
 
 		 988 aa  949    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 1354 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.56 
 
 		 1362 aa  711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  53.03 
 
 		 1025 aa  934    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  39.42 
 
 		 1437 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 1403 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  46.94 
 
 		 1381 aa  1090    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  43.37 
 
 		 1357 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  37.09 
 
 		 1284 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 		 1082 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  44.72 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 		 1118 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41 
 
 		 777 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  45.11 
 
 		 1070 aa  383  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  44.72 
 
 		 1073 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.94 
 
 		 1073 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 		 1112 aa  383  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 		 1055 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.54 
 
 		 1062 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 1082 aa  380  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 1082 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  45.04 
 
 		 1154 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  44.91 
 
 		 1082 aa  380  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 		 1073 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.96 
 
 		 1087 aa  379  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 		 1073 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  39.59 
 
 		 1021 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 		 1089 aa  373  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.61 
 
 		 1227 aa  370  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.91 
 
 		 1077 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 		 1160 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 918 aa  367  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  43.36 
 
 		 1070 aa  366  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.98 
 
 		 1125 aa  364  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.21 
 
 		 1102 aa  363  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  48.1 
 
 		 985 aa  363  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 		 1068 aa  360  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  40.21 
 
 		 1084 aa  360  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  40 
 
 		 1084 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 		 918 aa  358  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.45 
 
 		 977 aa  357  8.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.61 
 
 		 1104 aa  357  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.61 
 
 		 1110 aa  357  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 982 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 		 1139 aa  356  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 		 1108 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  34.94 
 
 		 918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  38.57 
 
 		 918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  38.37 
 
 		 918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  41.78 
 
 		 1141 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.37 
 
 		 918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  38.37 
 
 		 918 aa  355  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  38.49 
 
 		 918 aa  355  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.86 
 
 		 1088 aa  355  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  38.37 
 
 		 918 aa  354  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  38.37 
 
 		 918 aa  354  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  38.37 
 
 		 918 aa  354  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.76 
 
 		 1091 aa  352  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  39.87 
 
 		 1394 aa  352  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  39.94 
 
 		 1150 aa  351  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  43.58 
 
 		 1086 aa  351  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  41.7 
 
 		 1096 aa  351  7e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 		 1069 aa  350  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1088 aa  350  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.79 
 
 		 914 aa  350  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  39.4 
 
 		 1112 aa  350  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  43.23 
 
 		 918 aa  349  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1088 aa  348  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.98 
 
 		 1084 aa  347  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.59 
 
 		 1082 aa  347  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 		 1155 aa  346  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  44.01 
 
 		 666 aa  346  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 1105 aa  346  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.83 
 
 		 896 aa  346  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.47 
 
 		 1102 aa  346  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 1105 aa  345  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 		 1120 aa  344  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  39.75 
 
 		 1003 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  43.28 
 
 		 1163 aa  344  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  36.7 
 
 		 1068 aa  343  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.36 
 
 		 964 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  39.48 
 
 		 1031 aa  343  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 1066 aa  343  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.52 
 
 		 1068 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 876 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.8 
 
 		 1209 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 1068 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 950 aa  340  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  44.64 
 
 		 1100 aa  340  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 1261 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.76 
 
 		 1178 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  36.83 
 
 		 1159 aa  338  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  46.52 
 
 		 872 aa  337  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  36.94 
 
 		 1069 aa  337  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  37.37 
 
 		 1071 aa  337  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  45.42 
 
 		 663 aa  336  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  36.95 
 
 		 1164 aa  336  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  43.69 
 
 		 1113 aa  335  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>