More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0373 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  100 
 
 		 1159 aa  2372    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  39.68 
 
 		 1163 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 1160 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  36.85 
 
 		 1154 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.08 
 
 		 1227 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  36.91 
 
 		 1081 aa  594  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.49 
 
 		 1143 aa  589  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 		 1102 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  47.66 
 
 		 1096 aa  541  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.96 
 
 		 1110 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  45.86 
 
 		 1141 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 		 1118 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  37.26 
 
 		 1068 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  38.31 
 
 		 1071 aa  386  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 		 1091 aa  383  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 		 1069 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 982 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 1112 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.59 
 
 		 1068 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  43.85 
 
 		 1086 aa  380  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  32.95 
 
 		 964 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  36.36 
 
 		 1003 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  37.15 
 
 		 1112 aa  363  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 1129 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 		 1021 aa  360  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.65 
 
 		 1062 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.2 
 
 		 1087 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.04 
 
 		 1127 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  45.11 
 
 		 985 aa  357  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 		 1104 aa  356  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.41 
 
 		 1250 aa  355  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.05 
 
 		 1178 aa  353  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  38.7 
 
 		 1073 aa  351  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.08 
 
 		 1261 aa  350  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  36.35 
 
 		 1055 aa  349  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  36.41 
 
 		 1134 aa  350  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 		 1139 aa  350  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.49 
 
 		 1077 aa  349  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  37.57 
 
 		 1084 aa  348  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  38.43 
 
 		 988 aa  348  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.62 
 
 		 977 aa  348  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  37.76 
 
 		 1084 aa  348  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 		 1082 aa  347  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.07 
 
 		 1357 aa  347  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  37.98 
 
 		 1070 aa  346  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.41 
 
 		 1362 aa  347  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 1073 aa  346  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.56 
 
 		 1088 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 1073 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 1068 aa  344  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  38.02 
 
 		 1381 aa  343  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.02 
 
 		 1130 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.84 
 
 		 1209 aa  343  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 1073 aa  343  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  38.9 
 
 		 1120 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  35.76 
 
 		 1386 aa  341  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 1073 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  37.69 
 
 		 1070 aa  340  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 1082 aa  340  8e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 		 1171 aa  340  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1088 aa  340  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.44 
 
 		 959 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  36.54 
 
 		 1150 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  36.94 
 
 		 1082 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.94 
 
 		 1082 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.84 
 
 		 1102 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 		 876 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1088 aa  338  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.14 
 
 		 1025 aa  338  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 1068 aa  337  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.38 
 
 		 1155 aa  337  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  36.83 
 
 		 1449 aa  337  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  36.84 
 
 		 1120 aa  336  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  36.51 
 
 		 1120 aa  335  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.23 
 
 		 991 aa  335  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.75 
 
 		 1125 aa  333  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 		 1069 aa  333  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.64 
 
 		 777 aa  333  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.94 
 
 		 1091 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.42 
 
 		 1080 aa  332  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  36.05 
 
 		 1064 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.67 
 
 		 1403 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  39.33 
 
 		 1161 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.76 
 
 		 914 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  40.86 
 
 		 663 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  43.1 
 
 		 872 aa  329  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  40.86 
 
 		 773 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  36.22 
 
 		 1064 aa  327  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 1068 aa  327  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.3 
 
 		 1113 aa  326  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  42.67 
 
 		 918 aa  326  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 1113 aa  326  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  37.16 
 
 		 1437 aa  326  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 1108 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 918 aa  325  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  38.76 
 
 		 896 aa  324  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  41.53 
 
 		 1100 aa  324  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  35.71 
 
 		 1064 aa  324  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  35.71 
 
 		 1064 aa  324  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 918 aa  323  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>