More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5008 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  43.35 
 
 
1449 aa  713    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  45.01 
 
 
1354 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1403 aa  2869    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  45.55 
 
 
1386 aa  1124    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  48.93 
 
 
1357 aa  927    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  42.47 
 
 
988 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  41.93 
 
 
1025 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  38.58 
 
 
1437 aa  817    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  46.27 
 
 
1362 aa  1155    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  37.41 
 
 
1381 aa  739    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  35.67 
 
 
1284 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  42.86 
 
 
1070 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 
1082 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.63 
 
 
1073 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.81 
 
 
1073 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  45.83 
 
 
918 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 
1073 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  46.75 
 
 
1108 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 
1073 aa  396  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  45.42 
 
 
914 aa  393  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
1073 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 
1068 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.95 
 
 
666 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  46.32 
 
 
1070 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.46 
 
 
1087 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  41.21 
 
 
1105 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.21 
 
 
1105 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.83 
 
 
1068 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 
1021 aa  387  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.52 
 
 
1068 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  44.96 
 
 
1088 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  45.89 
 
 
1082 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.11 
 
 
1062 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  44.38 
 
 
896 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.36 
 
 
1112 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  45.8 
 
 
1082 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  45.8 
 
 
1082 aa  383  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
982 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  46.25 
 
 
872 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
876 aa  380  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.91 
 
 
663 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
1139 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  43.29 
 
 
1086 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
1055 aa  376  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
1091 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  45.3 
 
 
985 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.29 
 
 
964 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  44.49 
 
 
773 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
1104 aa  377  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  41.09 
 
 
1077 aa  373  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  39.04 
 
 
1112 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 
1261 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.33 
 
 
1003 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.3 
 
 
1084 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.11 
 
 
1155 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
1068 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.91 
 
 
1209 aa  370  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 
1069 aa  370  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
1129 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  42.77 
 
 
1150 aa  367  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.1 
 
 
1084 aa  367  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  40.46 
 
 
1080 aa  365  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  42.95 
 
 
1072 aa  365  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.18 
 
 
1088 aa  364  6e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  45.22 
 
 
1100 aa  363  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  36.78 
 
 
1154 aa  363  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.36 
 
 
1071 aa  362  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
1120 aa  362  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.43 
 
 
1088 aa  362  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.16 
 
 
1082 aa  361  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  44.82 
 
 
1127 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.27 
 
 
1178 aa  360  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.24 
 
 
977 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  42.43 
 
 
1142 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  37.06 
 
 
1250 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.77 
 
 
1125 aa  356  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  40.56 
 
 
1161 aa  356  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.58 
 
 
1091 aa  356  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  34.09 
 
 
1120 aa  356  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  40.25 
 
 
1069 aa  356  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.49 
 
 
1084 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.04 
 
 
991 aa  355  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.4 
 
 
1134 aa  355  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
1160 aa  355  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  40.04 
 
 
1069 aa  355  5e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.72 
 
 
1102 aa  354  5e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  34.74 
 
 
1120 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
1090 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.19 
 
 
1110 aa  353  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.15 
 
 
1130 aa  353  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  39.47 
 
 
777 aa  353  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 
1118 aa  353  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  36.39 
 
 
1064 aa  352  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  41.05 
 
 
918 aa  351  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  38.63 
 
 
1163 aa  351  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.78 
 
 
1112 aa  351  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 
933 aa  350  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.5 
 
 
1227 aa  350  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.82 
 
 
1048 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  36.17 
 
 
1064 aa  350  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>