More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1371 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.68 
 
 
1386 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  43.68 
 
 
1357 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  55.65 
 
 
988 aa  1042    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  39.39 
 
 
1354 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  100 
 
 
1381 aa  2786    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.29 
 
 
1362 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  55.3 
 
 
1025 aa  1033    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
1403 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 
1449 aa  1085    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  38.52 
 
 
1437 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  38.15 
 
 
1284 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
1021 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
1055 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.9 
 
 
1102 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  42.49 
 
 
1070 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
1073 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40 
 
 
1088 aa  383  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.33 
 
 
1062 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 
1073 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.62 
 
 
1070 aa  379  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  39.64 
 
 
1154 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  32.74 
 
 
1082 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 
1112 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.77 
 
 
977 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.39 
 
 
1082 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
1068 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  31.81 
 
 
1250 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  40.5 
 
 
777 aa  373  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  32.74 
 
 
1082 aa  373  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.5 
 
 
1073 aa  369  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 
1073 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
1118 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
1089 aa  369  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
1073 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
1160 aa  367  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
1091 aa  365  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
1082 aa  363  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  47.2 
 
 
985 aa  363  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
1108 aa  362  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
1066 aa  362  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.09 
 
 
1087 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.36 
 
 
1155 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.36 
 
 
1068 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  41.01 
 
 
1150 aa  358  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  44.52 
 
 
1120 aa  357  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 
982 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.79 
 
 
1125 aa  356  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.47 
 
 
914 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.04 
 
 
1003 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.07 
 
 
1088 aa  354  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  44.47 
 
 
918 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  42.61 
 
 
1088 aa  353  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.01 
 
 
1091 aa  352  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.57 
 
 
1104 aa  352  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.89 
 
 
1227 aa  350  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.27 
 
 
1100 aa  350  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  34.04 
 
 
1031 aa  349  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.95 
 
 
1068 aa  349  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  40.71 
 
 
1209 aa  349  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.33 
 
 
959 aa  350  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
918 aa  349  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  44.04 
 
 
666 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  41.58 
 
 
918 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
1068 aa  348  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 
1171 aa  348  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  37.95 
 
 
1159 aa  348  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.92 
 
 
1077 aa  348  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
1139 aa  348  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  44.04 
 
 
1105 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
1105 aa  347  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.89 
 
 
964 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.42 
 
 
1110 aa  347  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  38.14 
 
 
1112 aa  347  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.85 
 
 
1071 aa  347  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.53 
 
 
1082 aa  346  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
918 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
950 aa  346  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  41.37 
 
 
918 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.98 
 
 
991 aa  345  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  39.4 
 
 
1141 aa  344  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.04 
 
 
1178 aa  344  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
1129 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  41.57 
 
 
1086 aa  343  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  41.16 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  41.16 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
1261 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  36.35 
 
 
1080 aa  342  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  38.89 
 
 
1086 aa  343  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  41.16 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  41.16 
 
 
918 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  41.16 
 
 
918 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  41.16 
 
 
918 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.96 
 
 
918 aa  340  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.41 
 
 
1081 aa  340  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  38.27 
 
 
1163 aa  340  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  38.18 
 
 
1394 aa  340  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  42.89 
 
 
1113 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.89 
 
 
1113 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.95 
 
 
663 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  38.22 
 
 
1161 aa  339  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>