More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1148 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  100 
 
 		 1069 aa  2136    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  37.33 
 
 		 1084 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  96.35 
 
 		 1069 aa  2048    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  37.51 
 
 		 1084 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.67 
 
 		 1087 aa  562  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 1082 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.99 
 
 		 1077 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 		 1069 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 1112 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.35 
 
 		 1084 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 1139 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 		 1089 aa  446  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  38.87 
 
 		 1125 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.04 
 
 		 1082 aa  442  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.68 
 
 		 1102 aa  422  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  30.8 
 
 		 1064 aa  422  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.79 
 
 		 1064 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 1068 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.63 
 
 		 1064 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.54 
 
 		 1064 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.54 
 
 		 1064 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  30.89 
 
 		 1064 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.7 
 
 		 1064 aa  413  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.47 
 
 		 1064 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.95 
 
 		 1064 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  37.24 
 
 		 1394 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.59 
 
 		 1104 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.26 
 
 		 914 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  34.05 
 
 		 1032 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.08 
 
 		 918 aa  383  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.29 
 
 		 1129 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 1108 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.9 
 
 		 1068 aa  380  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  40.5 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.17 
 
 		 1034 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.21 
 
 		 1071 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 		 1105 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  39.92 
 
 		 1181 aa  376  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  41.77 
 
 		 666 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 		 1105 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 1069 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 		 1091 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.7 
 
 		 1031 aa  376  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  40.12 
 
 		 773 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 1068 aa  373  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 		 1068 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  35.03 
 
 		 1031 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 		 1261 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 1021 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.4 
 
 		 1068 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  38.54 
 
 		 872 aa  365  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.01 
 
 		 896 aa  363  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  41.28 
 
 		 1362 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  38.55 
 
 		 1250 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1066 aa  363  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 1055 aa  362  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  39.7 
 
 		 1127 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  38.68 
 
 		 1164 aa  360  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  38.42 
 
 		 876 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  41.4 
 
 		 1130 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.52 
 
 		 1178 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.68 
 
 		 964 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.92 
 
 		 1091 aa  357  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.88 
 
 		 982 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  39.28 
 
 		 959 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.48 
 
 		 1386 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  41.51 
 
 		 1357 aa  356  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 		 1403 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.52 
 
 		 1088 aa  356  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  37.57 
 
 		 1082 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  37.57 
 
 		 1082 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  41.51 
 
 		 1437 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.72 
 
 		 1086 aa  354  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  38.27 
 
 		 1070 aa  353  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  42.24 
 
 		 1070 aa  352  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  40.64 
 
 		 1086 aa  351  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  39.76 
 
 		 1082 aa  351  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  40.36 
 
 		 1073 aa  351  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  37.89 
 
 		 1080 aa  350  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 1118 aa  350  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1155 aa  350  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.45 
 
 		 977 aa  349  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  36.45 
 
 		 1150 aa  349  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  41.32 
 
 		 1284 aa  348  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.87 
 
 		 1100 aa  348  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  38.66 
 
 		 777 aa  348  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.51 
 
 		 907 aa  347  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1088 aa  347  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1088 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 1073 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  39.23 
 
 		 1003 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 		 1073 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.48 
 
 		 1062 aa  343  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.76 
 
 		 1073 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.09 
 
 		 1025 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 1073 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 		 1164 aa  340  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  37.89 
 
 		 1354 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  39.06 
 
 		 1209 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>