More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13470 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 		 1089 aa  890    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 		 1102 aa  2265    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.64 
 
 		 1082 aa  919    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  40.33 
 
 		 1394 aa  785    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  33.05 
 
 		 1077 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.7 
 
 		 907 aa  538  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 1069 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.24 
 
 		 1087 aa  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.55 
 
 		 1084 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 1082 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  30.35 
 
 		 1125 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 1112 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 1066 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.76 
 
 		 1064 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.67 
 
 		 1064 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.76 
 
 		 1064 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.67 
 
 		 1064 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.6 
 
 		 1064 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.41 
 
 		 1084 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  30.48 
 
 		 1064 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 1068 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.28 
 
 		 1064 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  30.33 
 
 		 1064 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  30.11 
 
 		 1064 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  29.77 
 
 		 1084 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 		 1139 aa  432  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  35.68 
 
 		 1069 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  35.58 
 
 		 1069 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  33.67 
 
 		 1031 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.59 
 
 		 1068 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.9 
 
 		 1068 aa  396  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 1091 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  43.7 
 
 		 1181 aa  387  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 1055 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.07 
 
 		 1071 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 		 1118 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  42.15 
 
 		 1357 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 		 1104 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  40.07 
 
 		 1381 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.73 
 
 		 1086 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.07 
 
 		 1134 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  42.02 
 
 		 1284 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.08 
 
 		 1034 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.25 
 
 		 1155 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  38.85 
 
 		 1080 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  41.59 
 
 		 1070 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  43.47 
 
 		 985 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 		 1069 aa  370  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  43.5 
 
 		 1150 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  39.64 
 
 		 1386 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 1021 aa  366  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  46.54 
 
 		 1209 aa  366  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  39.11 
 
 		 1362 aa  366  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 1068 aa  366  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  44.75 
 
 		 777 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 		 1113 aa  365  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  44.19 
 
 		 1113 aa  365  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  41.1 
 
 		 1073 aa  365  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.76 
 
 		 1100 aa  365  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  42.35 
 
 		 1127 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  41.65 
 
 		 1025 aa  364  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.35 
 
 		 1082 aa  364  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 		 1449 aa  363  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  40.47 
 
 		 1354 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.08 
 
 		 914 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 1082 aa  363  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  41.17 
 
 		 1082 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  38.99 
 
 		 1070 aa  362  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.95 
 
 		 991 aa  361  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 1073 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 		 1073 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  40.23 
 
 		 1073 aa  360  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.66 
 
 		 1062 aa  360  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.88 
 
 		 918 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  42.11 
 
 		 1178 aa  360  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 		 982 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  46.17 
 
 		 1013 aa  359  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.88 
 
 		 1088 aa  359  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.88 
 
 		 1091 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  36.53 
 
 		 1032 aa  357  6.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.67 
 
 		 1088 aa  356  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.17 
 
 		 1154 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.77 
 
 		 1031 aa  356  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 1073 aa  355  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 		 1403 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  43.98 
 
 		 1086 aa  353  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  40.87 
 
 		 1130 aa  353  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 1129 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  40.83 
 
 		 1048 aa  351  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  38.5 
 
 		 1088 aa  350  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.82 
 
 		 977 aa  350  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 		 1068 aa  350  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  39.68 
 
 		 621 aa  348  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.92 
 
 		 1110 aa  348  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 		 1108 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  38.63 
 
 		 1437 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 		 1028 aa  346  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  40.45 
 
 		 896 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  41.13 
 
 		 1141 aa  342  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 		 1261 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>