More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0664 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  100 
 
 
1125 aa  2283    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.14 
 
 
1077 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.83 
 
 
1087 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
1082 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
1112 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.6 
 
 
1084 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.83 
 
 
1068 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
1069 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
1066 aa  529  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.05 
 
 
1139 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.42 
 
 
1064 aa  529  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.34 
 
 
1064 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  37.11 
 
 
1064 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  36.91 
 
 
1064 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  36.78 
 
 
1064 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  36.91 
 
 
1064 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  44.1 
 
 
1031 aa  505  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  37.11 
 
 
1064 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  36.91 
 
 
1064 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.7 
 
 
1082 aa  506  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.35 
 
 
1102 aa  499  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  36.52 
 
 
1064 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  35.64 
 
 
1084 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  35.85 
 
 
1084 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 
1089 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  48.82 
 
 
1181 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  38.87 
 
 
1069 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  28.83 
 
 
1394 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  38.4 
 
 
1069 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.54 
 
 
1034 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
1091 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  45.32 
 
 
914 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.22 
 
 
1071 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  44.89 
 
 
918 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.26 
 
 
1068 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  44.52 
 
 
1086 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
982 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.2 
 
 
663 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
1069 aa  422  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  41.8 
 
 
773 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.38 
 
 
1068 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.76 
 
 
1068 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.95 
 
 
1104 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  42.45 
 
 
876 aa  416  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.2 
 
 
872 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  46.98 
 
 
977 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 
1068 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  44.28 
 
 
1086 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 
1073 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 
1073 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
1055 aa  406  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.8 
 
 
1088 aa  406  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.8 
 
 
1088 aa  406  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  43.92 
 
 
1178 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
1073 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.83 
 
 
1031 aa  405  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.75 
 
 
1073 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  42.98 
 
 
1100 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.99 
 
 
1091 aa  402  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.87 
 
 
1088 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.15 
 
 
1070 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.92 
 
 
1108 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  37.54 
 
 
1032 aa  399  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.31 
 
 
777 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.32 
 
 
1209 aa  399  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.46 
 
 
1073 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.38 
 
 
1070 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  43.71 
 
 
896 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  41.56 
 
 
1150 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  39.35 
 
 
1082 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  39.35 
 
 
1082 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  39.17 
 
 
1082 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  45.35 
 
 
1080 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
1155 aa  396  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  42.98 
 
 
1003 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  44.87 
 
 
1113 aa  393  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
1113 aa  393  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.13 
 
 
1386 aa  393  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  41.76 
 
 
964 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.95 
 
 
1362 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  35 
 
 
1021 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 
1120 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 
1066 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  36.52 
 
 
1284 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  43.92 
 
 
1130 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  40.34 
 
 
991 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
1129 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.11 
 
 
1134 aa  380  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
1105 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  42.86 
 
 
666 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.21 
 
 
1250 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
1105 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 
1261 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.28 
 
 
907 aa  376  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.18 
 
 
1112 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 
1090 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.11 
 
 
1062 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  36.86 
 
 
959 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 
1118 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  35.57 
 
 
903 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>