More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0596 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 		 1261 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  100 
 
 		 1250 aa  2602    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  48.4 
 
 		 959 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 		 1129 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.81 
 
 		 1127 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 1068 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  34.73 
 
 		 1130 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 		 1021 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 		 1055 aa  563  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 1066 aa  562  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.17 
 
 		 964 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  43 
 
 		 982 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  44.16 
 
 		 1003 aa  523  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  44.5 
 
 		 1112 aa  513  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  42.62 
 
 		 977 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.93 
 
 		 1062 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.27 
 
 		 1068 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 		 1091 aa  466  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.97 
 
 		 1069 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.14 
 
 		 1071 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.35 
 
 		 1068 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.59 
 
 		 1068 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  35.95 
 
 		 1086 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.76 
 
 		 1362 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.68 
 
 		 1386 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.55 
 
 		 985 aa  393  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.72 
 
 		 1134 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  35.34 
 
 		 1070 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  31.3 
 
 		 1081 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  36.49 
 
 		 1163 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.92 
 
 		 1088 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 1171 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  35.06 
 
 		 1082 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.77 
 
 		 1070 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 966 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.69 
 
 		 1073 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  33.47 
 
 		 1178 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.92 
 
 		 1082 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.25 
 
 		 1082 aa  387  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 		 1073 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.8 
 
 		 1087 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 		 1073 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.75 
 
 		 1154 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 		 1120 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 		 1073 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.92 
 
 		 1077 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 		 1112 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.41 
 
 		 1110 aa  379  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.26 
 
 		 914 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 		 1073 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  35.01 
 
 		 1108 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.21 
 
 		 1125 aa  376  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.41 
 
 		 1227 aa  376  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  34.26 
 
 		 918 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 1104 aa  376  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.96 
 
 		 1091 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.32 
 
 		 896 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 1155 aa  376  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  32.11 
 
 		 1150 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  36.39 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.82 
 
 		 1143 aa  372  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 		 1082 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  34.02 
 
 		 1113 aa  373  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 1113 aa  373  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.95 
 
 		 1080 aa  373  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 1105 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  41.65 
 
 		 1100 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1088 aa  370  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  39.21 
 
 		 1088 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 1160 aa  366  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 1139 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.04 
 
 		 872 aa  365  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  40.3 
 
 		 1181 aa  365  4e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 		 876 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.45 
 
 		 663 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 1105 aa  364  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.24 
 
 		 773 aa  363  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  31.81 
 
 		 1381 aa  363  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  41.86 
 
 		 666 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  38.55 
 
 		 1069 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  38.36 
 
 		 1069 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 1102 aa  360  7e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1096 aa  360  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1086 aa  360  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  38.27 
 
 		 1161 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 1069 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  36.53 
 
 		 1209 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  36.12 
 
 		 1072 aa  358  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.7 
 
 		 1084 aa  358  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 1118 aa  356  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 1403 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  34.41 
 
 		 1159 aa  355  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 1090 aa  355  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  37.01 
 
 		 1126 aa  353  8.999999999999999e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.16 
 
 		 1084 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  40.47 
 
 		 1354 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 1110 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  34.46 
 
 		 1142 aa  352  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  33.64 
 
 		 1120 aa  352  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.34 
 
 		 918 aa  350  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>