More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0994 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  49.6 
 
 
1120 aa  1034    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  45.53 
 
 
1164 aa  936    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  50 
 
 
1120 aa  1044    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  100 
 
 
1142 aa  2318    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  45.38 
 
 
1164 aa  886    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.82 
 
 
1112 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.92 
 
 
1055 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.2 
 
 
1110 aa  376  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.1 
 
 
1068 aa  376  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  43.15 
 
 
1362 aa  373  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  43.36 
 
 
1386 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  36.74 
 
 
1003 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 
982 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  40.41 
 
 
1070 aa  362  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.97 
 
 
1062 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
1261 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.43 
 
 
1403 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
1021 aa  357  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.48 
 
 
1088 aa  356  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.24 
 
 
1073 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
1073 aa  354  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.44 
 
 
1134 aa  353  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  37.09 
 
 
1130 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  44.64 
 
 
1354 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.46 
 
 
1250 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.53 
 
 
1071 aa  352  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
1073 aa  351  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.6 
 
 
1178 aa  350  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.8 
 
 
1154 aa  350  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
1073 aa  349  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
1160 aa  348  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
1073 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 
1112 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  37.24 
 
 
1064 aa  348  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.04 
 
 
1091 aa  348  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  37.41 
 
 
1064 aa  348  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  40.78 
 
 
1070 aa  347  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.88 
 
 
914 aa  347  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.74 
 
 
773 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  38.86 
 
 
1082 aa  346  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
1129 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.56 
 
 
1143 aa  345  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.54 
 
 
663 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  42.35 
 
 
1113 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
1113 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  38.86 
 
 
1082 aa  345  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40 
 
 
1125 aa  344  5e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.85 
 
 
1080 aa  344  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  37.24 
 
 
1064 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.48 
 
 
918 aa  343  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  37.24 
 
 
1064 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
1068 aa  343  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  37.24 
 
 
1064 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  38.67 
 
 
1082 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  37.24 
 
 
1064 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  37.24 
 
 
1064 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  37.26 
 
 
1064 aa  343  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  40.33 
 
 
1127 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.38 
 
 
964 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.65 
 
 
1088 aa  342  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.92 
 
 
1077 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.28 
 
 
977 aa  340  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  37.06 
 
 
1064 aa  340  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  36.89 
 
 
1437 aa  340  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1066 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 
1066 aa  339  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
1104 aa  339  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 
1069 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.22 
 
 
1068 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.56 
 
 
1088 aa  338  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.86 
 
 
1087 aa  338  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  42.17 
 
 
985 aa  338  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
876 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.49 
 
 
1068 aa  337  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  36.3 
 
 
1163 aa  334  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
1091 aa  334  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 
1082 aa  333  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
1120 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
1068 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
1108 aa  332  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  38.43 
 
 
1086 aa  331  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
1357 aa  330  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
1155 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.37 
 
 
991 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  37.52 
 
 
1161 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.91 
 
 
777 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  37.52 
 
 
1081 aa  328  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.33 
 
 
1082 aa  328  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.44 
 
 
1150 aa  327  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  37.42 
 
 
1141 aa  327  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.03 
 
 
896 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.71 
 
 
872 aa  325  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
1139 aa  325  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  35.88 
 
 
891 aa  324  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.11 
 
 
1227 aa  324  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  37.45 
 
 
959 aa  324  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
1118 aa  324  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
950 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.87 
 
 
1084 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.48 
 
 
1102 aa  320  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>