More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3248 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  38.11 
 
 		 1077 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  100 
 
 		 1084 aa  2234    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 1068 aa  810    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  40.05 
 
 		 1064 aa  800    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  39.96 
 
 		 1064 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  40.15 
 
 		 1064 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  40.05 
 
 		 1064 aa  800    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  40.11 
 
 		 1064 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  40.05 
 
 		 1064 aa  802    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  42.15 
 
 		 1087 aa  801    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 		 1066 aa  811    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  40.15 
 
 		 1064 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  40.62 
 
 		 1064 aa  810    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 		 1082 aa  759    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  39.87 
 
 		 1064 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  43.07 
 
 		 1069 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 1112 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.6 
 
 		 1125 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.42 
 
 		 1034 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.65 
 
 		 1084 aa  522  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  34.15 
 
 		 1084 aa  522  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.28 
 
 		 1031 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.55 
 
 		 1102 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  32.82 
 
 		 1032 aa  505  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 1139 aa  505  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  36 
 
 		 1031 aa  497  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.76 
 
 		 1082 aa  492  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 1089 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  30.35 
 
 		 1069 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  29.3 
 
 		 1394 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  31.99 
 
 		 1069 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  45.66 
 
 		 1181 aa  416  1e-114  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.53 
 
 		 1068 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  42.73 
 
 		 1070 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.38 
 
 		 1068 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 		 1091 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.45 
 
 		 1071 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 		 1069 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.83 
 
 		 1104 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.09 
 
 		 1088 aa  389  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  37.25 
 
 		 1086 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  37.25 
 
 		 1062 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.11 
 
 		 1362 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  41.11 
 
 		 1150 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 1068 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 		 1155 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.28 
 
 		 1091 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.65 
 
 		 977 aa  380  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  42.7 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.67 
 
 		 1080 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  36.18 
 
 		 991 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.09 
 
 		 1100 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.11 
 
 		 1386 aa  376  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 		 1113 aa  376  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  41.84 
 
 		 1113 aa  376  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 		 1073 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 		 1073 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 		 1073 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 1055 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.03 
 
 		 907 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 		 1073 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  39.53 
 
 		 1178 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.93 
 
 		 1082 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  42.14 
 
 		 1082 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.8 
 
 		 1112 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  41.74 
 
 		 1070 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.6 
 
 		 1088 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.25 
 
 		 914 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.62 
 
 		 1108 aa  370  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.4 
 
 		 1088 aa  366  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.18 
 
 		 1134 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  42.05 
 
 		 918 aa  365  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.46 
 
 		 918 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.3 
 
 		 918 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.72 
 
 		 1073 aa  361  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 1021 aa  361  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.9 
 
 		 918 aa  361  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  38.7 
 
 		 918 aa  360  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 		 918 aa  360  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  38.54 
 
 		 918 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  38.7 
 
 		 918 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  35.7 
 
 		 1250 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.82 
 
 		 896 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 		 1090 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  38.54 
 
 		 918 aa  357  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  38.54 
 
 		 918 aa  357  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  38.54 
 
 		 918 aa  356  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.41 
 
 		 964 aa  357  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  38.54 
 
 		 918 aa  357  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 		 1403 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 		 1129 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.16 
 
 		 1209 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 		 982 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 		 1068 aa  353  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 		 1120 aa  353  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  42.19 
 
 		 666 aa  352  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 1105 aa  351  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 		 876 aa  351  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.43 
 
 		 663 aa  350  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.1 
 
 		 1227 aa  349  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>