More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 
1227 aa  2445    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  41.27 
 
 
1163 aa  790    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.07 
 
 
1160 aa  873    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  42.64 
 
 
1154 aa  861    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  40.61 
 
 
1141 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.96 
 
 
1143 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  44.38 
 
 
1159 aa  612  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  45.34 
 
 
1096 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.17 
 
 
1110 aa  598  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 
1102 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.49 
 
 
1118 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  46.67 
 
 
1081 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.77 
 
 
1068 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.33 
 
 
1086 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
1069 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
1091 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.31 
 
 
1071 aa  393  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  38.99 
 
 
1112 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.48 
 
 
1261 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
1112 aa  383  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.02 
 
 
1068 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  37.97 
 
 
1082 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  37.97 
 
 
1082 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  37.6 
 
 
1082 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  36.41 
 
 
1250 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
1055 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
1021 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.14 
 
 
1178 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.45 
 
 
1062 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  41.22 
 
 
1070 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.26 
 
 
964 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
1068 aa  376  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  38.36 
 
 
1108 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.86 
 
 
977 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
1068 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.13 
 
 
1080 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  39.43 
 
 
1449 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1073 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.5 
 
 
1077 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1073 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  43.29 
 
 
1073 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 
1073 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.25 
 
 
1087 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
1082 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.86 
 
 
1088 aa  369  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  40.49 
 
 
1070 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  40.42 
 
 
1073 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  36.82 
 
 
1003 aa  367  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
1113 aa  362  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  42.29 
 
 
1113 aa  362  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
1120 aa  360  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  36.84 
 
 
918 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 
1139 aa  360  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.97 
 
 
1209 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.74 
 
 
914 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
1105 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.1 
 
 
1084 aa  355  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  39.1 
 
 
666 aa  354  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
1104 aa  354  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 
1105 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.04 
 
 
1082 aa  353  8.999999999999999e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.43 
 
 
1403 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  40.04 
 
 
777 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
1068 aa  350  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.93 
 
 
1084 aa  350  8e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.87 
 
 
1091 aa  350  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  36.7 
 
 
1064 aa  350  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  36.7 
 
 
1064 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  36.7 
 
 
1064 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  36.7 
 
 
1064 aa  349  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.71 
 
 
872 aa  349  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  36.87 
 
 
1064 aa  348  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  37.24 
 
 
1088 aa  348  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.82 
 
 
1084 aa  348  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  36.9 
 
 
1064 aa  348  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  38.01 
 
 
1381 aa  347  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  44.58 
 
 
985 aa  347  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
1171 aa  347  7e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  37.24 
 
 
1088 aa  347  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  35.1 
 
 
1127 aa  347  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.8 
 
 
1102 aa  346  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.31 
 
 
1134 aa  346  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  36.54 
 
 
1064 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  36.22 
 
 
1064 aa  346  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  36.46 
 
 
1025 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  36.22 
 
 
1064 aa  343  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
1066 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.63 
 
 
1130 aa  343  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  40.48 
 
 
896 aa  341  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.66 
 
 
1362 aa  341  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  36.15 
 
 
1386 aa  340  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  38.51 
 
 
1164 aa  340  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
1066 aa  340  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  39.73 
 
 
988 aa  340  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
1155 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  41.01 
 
 
1357 aa  338  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  36.91 
 
 
1150 aa  337  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  42.97 
 
 
1100 aa  336  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  36.81 
 
 
1354 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>