More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3931 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  100 
 
 		 1178 aa  2396    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  36.35 
 
 		 1086 aa  625  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 		 1113 aa  616  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  39.45 
 
 		 1113 aa  616  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 		 1108 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  38.21 
 
 		 1086 aa  596  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  37.13 
 
 		 1091 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  37.18 
 
 		 1150 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 1104 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 1120 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 		 1155 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 1105 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.77 
 
 		 1100 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  48.38 
 
 		 1134 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  50.81 
 
 		 918 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1088 aa  574  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.72 
 
 		 1088 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  51.06 
 
 		 914 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 		 1105 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  44.33 
 
 		 876 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.6 
 
 		 1080 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  50.08 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  49.92 
 
 		 773 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  47.63 
 
 		 666 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  42.29 
 
 		 896 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.31 
 
 		 872 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.86 
 
 		 1082 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  36.63 
 
 		 1126 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  40.5 
 
 		 1082 aa  539  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.38 
 
 		 1082 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  48.55 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.48 
 
 		 1070 aa  532  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 		 1073 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 		 1073 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  54.4 
 
 		 1209 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 		 1073 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  48.14 
 
 		 777 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 		 1073 aa  526  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  33.71 
 
 		 1088 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  47.24 
 
 		 1073 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  44.9 
 
 		 1110 aa  515  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 1090 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  46.3 
 
 		 991 aa  499  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  44.34 
 
 		 1161 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  49.06 
 
 		 1068 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  49.47 
 
 		 1068 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.54 
 
 		 1069 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  49.89 
 
 		 1071 aa  452  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.04 
 
 		 1091 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 		 1068 aa  446  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.17 
 
 		 1082 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  41.81 
 
 		 1087 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 		 1055 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.81 
 
 		 1112 aa  410  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 		 1261 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  43.92 
 
 		 1125 aa  403  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 		 1021 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  43.23 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.9 
 
 		 1077 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.17 
 
 		 1110 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 		 1139 aa  393  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  42.61 
 
 		 1062 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  41.13 
 
 		 1084 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  41.57 
 
 		 1362 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  41.67 
 
 		 1181 aa  384  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  42.61 
 
 		 1003 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  41.77 
 
 		 1386 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.74 
 
 		 1250 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  41.13 
 
 		 1084 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.57 
 
 		 933 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  42.15 
 
 		 924 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 		 925 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  45.34 
 
 		 1068 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  41.89 
 
 		 1072 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 		 1069 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 982 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  41.65 
 
 		 1066 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.11 
 
 		 1078 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.14 
 
 		 1227 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  41.98 
 
 		 1064 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  44.83 
 
 		 985 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  42.18 
 
 		 1064 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.8 
 
 		 1082 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.93 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  41.01 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  41.98 
 
 		 1064 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.93 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.73 
 
 		 918 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  41.13 
 
 		 918 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  39.53 
 
 		 1084 aa  370  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 		 1160 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  41.98 
 
 		 1064 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.93 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.55 
 
 		 964 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 		 1129 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.52 
 
 		 918 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.22 
 
 		 1143 aa  368  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  41.98 
 
 		 1064 aa  366  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  41.98 
 
 		 1064 aa  367  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>