More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3216 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  94.04 
 
 
924 aa  1768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  48.5 
 
 
918 aa  866    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  48.21 
 
 
918 aa  864    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  75.56 
 
 
933 aa  1432    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  48.56 
 
 
918 aa  866    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  48.67 
 
 
918 aa  866    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  48.17 
 
 
918 aa  857    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  48.67 
 
 
918 aa  867    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  48.67 
 
 
918 aa  868    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  48.67 
 
 
918 aa  867    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
918 aa  863    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  48.67 
 
 
918 aa  866    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  45.75 
 
 
980 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  48.56 
 
 
918 aa  867    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
925 aa  1882    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  44.4 
 
 
1013 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.36 
 
 
1007 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  45.44 
 
 
1050 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  41.31 
 
 
1078 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  44.31 
 
 
1048 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  41.46 
 
 
1007 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
1074 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.74 
 
 
1048 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  44.15 
 
 
990 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  42.51 
 
 
1047 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  41.37 
 
 
1006 aa  548  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
1112 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.43 
 
 
1047 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  39.89 
 
 
1072 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  43.24 
 
 
1019 aa  537  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.12 
 
 
1028 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.63 
 
 
1029 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  43.1 
 
 
1175 aa  526  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.81 
 
 
1019 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  42.31 
 
 
1033 aa  515  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  41.67 
 
 
886 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  43.36 
 
 
1185 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  44.27 
 
 
958 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  44.68 
 
 
1040 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
1152 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.33 
 
 
1067 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.02 
 
 
1026 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  41.36 
 
 
988 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  41.11 
 
 
1065 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.58 
 
 
1099 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  46.84 
 
 
949 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  40.94 
 
 
1063 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  43.51 
 
 
903 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  51.56 
 
 
621 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 
892 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  40.42 
 
 
898 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  40.42 
 
 
901 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  47.57 
 
 
1531 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  42.49 
 
 
899 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  39.08 
 
 
1194 aa  435  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  39.14 
 
 
902 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  39.83 
 
 
917 aa  429  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.12 
 
 
895 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
931 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 
617 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.95 
 
 
1178 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  45.86 
 
 
872 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  45.53 
 
 
663 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.11 
 
 
773 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
1021 aa  370  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.25 
 
 
1080 aa  369  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 
1113 aa  366  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  44.6 
 
 
1113 aa  366  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.8 
 
 
982 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.15 
 
 
1068 aa  364  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.74 
 
 
1108 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.64 
 
 
964 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
1112 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.98 
 
 
918 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.79 
 
 
914 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  43.35 
 
 
1150 aa  362  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.59 
 
 
1077 aa  361  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.88 
 
 
1155 aa  360  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
1120 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  41.43 
 
 
1086 aa  359  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
1082 aa  358  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.25 
 
 
1091 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  43.4 
 
 
666 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 
1055 aa  357  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.82 
 
 
1087 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  42.11 
 
 
1386 aa  356  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 
1105 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 
1105 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  42.52 
 
 
1070 aa  355  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  42.39 
 
 
1088 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
1069 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.92 
 
 
1209 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  44.26 
 
 
1088 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.72 
 
 
1088 aa  354  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  43 
 
 
1073 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  42.41 
 
 
1362 aa  354  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  43 
 
 
1073 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 
1104 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.83 
 
 
1068 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>