More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2580 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  42.3 
 
 		 1087 aa  825    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1069 aa  2192    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 1082 aa  769    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.78 
 
 		 1084 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.39 
 
 		 1077 aa  769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 1066 aa  629  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 1112 aa  628  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 		 1068 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.58 
 
 		 1064 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.96 
 
 		 1064 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  32.92 
 
 		 1064 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  32.92 
 
 		 1064 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  32.37 
 
 		 1064 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  32.92 
 
 		 1064 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.11 
 
 		 1064 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  32.92 
 
 		 1064 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.86 
 
 		 1064 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.27 
 
 		 1125 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  35.14 
 
 		 1084 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  34.67 
 
 		 1084 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.4 
 
 		 1102 aa  556  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40 
 
 		 1082 aa  544  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.78 
 
 		 1089 aa  529  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.41 
 
 		 1139 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  38.96 
 
 		 1031 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  34.89 
 
 		 1069 aa  476  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  35.04 
 
 		 1069 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  39.79 
 
 		 1181 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  29.63 
 
 		 1394 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.64 
 
 		 1068 aa  436  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 1091 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.36 
 
 		 1068 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.6 
 
 		 1034 aa  422  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 1069 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.38 
 
 		 1071 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.55 
 
 		 907 aa  413  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  31.11 
 
 		 1032 aa  411  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  43.62 
 
 		 1086 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.95 
 
 		 914 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.75 
 
 		 1031 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.76 
 
 		 918 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.54 
 
 		 1178 aa  406  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.27 
 
 		 1108 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 1068 aa  399  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.69 
 
 		 1113 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 1055 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  42.64 
 
 		 896 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.69 
 
 		 1113 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 		 1021 aa  396  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  45.05 
 
 		 977 aa  396  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  42.03 
 
 		 1070 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.96 
 
 		 876 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.8 
 
 		 1091 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 1068 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  41.54 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  41.73 
 
 		 773 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  38.78 
 
 		 1150 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 1073 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  40.5 
 
 		 1073 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.33 
 
 		 1082 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.45 
 
 		 1080 aa  386  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 		 1105 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 		 1105 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 1073 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.84 
 
 		 666 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  42.34 
 
 		 1070 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 1073 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 1104 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  35.43 
 
 		 1250 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  39.79 
 
 		 1209 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 		 982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.47 
 
 		 1088 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.61 
 
 		 1134 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.77 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.47 
 
 		 1100 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  43.49 
 
 		 1082 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  43.49 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32.49 
 
 		 1062 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.14 
 
 		 1261 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  34.42 
 
 		 891 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 		 1090 aa  376  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  41.88 
 
 		 872 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.83 
 
 		 964 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 1066 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.45 
 
 		 1362 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  34.19 
 
 		 1112 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 		 1449 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.64 
 
 		 1386 aa  373  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1088 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1088 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 1129 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  33.07 
 
 		 959 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  43.47 
 
 		 1003 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 		 1118 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 		 1120 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  41.27 
 
 		 621 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  38.64 
 
 		 918 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  32.99 
 
 		 1127 aa  363  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>