More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0516 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.95 
 
 
1155 aa  855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
1105 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  43.87 
 
 
1113 aa  794    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  51.09 
 
 
918 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  45.62 
 
 
1100 aa  783    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  52.26 
 
 
876 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  53.54 
 
 
773 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  50.66 
 
 
914 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  45.34 
 
 
1091 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  44.6 
 
 
1086 aa  786    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  45.54 
 
 
1150 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1104 aa  2219    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  49.64 
 
 
1126 aa  683    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  39.72 
 
 
1108 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  54.46 
 
 
663 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
1105 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  51.97 
 
 
991 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
1113 aa  794    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  37.74 
 
 
1086 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  54.2 
 
 
872 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  52.29 
 
 
666 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
1073 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
1073 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1073 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 
1073 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  36.81 
 
 
1088 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  50.29 
 
 
896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.93 
 
 
1134 aa  602  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.91 
 
 
1080 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  36.22 
 
 
1088 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
1120 aa  586  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  45.92 
 
 
1073 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.94 
 
 
1209 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  46.21 
 
 
1082 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  46.21 
 
 
1082 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  46.06 
 
 
1082 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  46.6 
 
 
1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.01 
 
 
1178 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  45.3 
 
 
1070 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  47.72 
 
 
1088 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  46.67 
 
 
777 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 
1090 aa  549  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
1110 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  40.72 
 
 
1161 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.17 
 
 
1068 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.35 
 
 
1071 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
1069 aa  452  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35 
 
 
1068 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
1091 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 
1068 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  48.25 
 
 
1055 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  42.05 
 
 
1062 aa  426  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  46.9 
 
 
1021 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  42.95 
 
 
1125 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  43.7 
 
 
1087 aa  416  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  46.23 
 
 
1068 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  42.11 
 
 
1031 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.85 
 
 
1139 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.03 
 
 
1112 aa  406  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1082 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.58 
 
 
977 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.4 
 
 
1077 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
1112 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
1261 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.14 
 
 
964 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.62 
 
 
982 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.41 
 
 
1069 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  45.53 
 
 
1362 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  45.11 
 
 
1386 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
1129 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 
1066 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  39.59 
 
 
1069 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  43.65 
 
 
959 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  43.83 
 
 
1084 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  40.84 
 
 
1181 aa  385  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  43.7 
 
 
1127 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  47.92 
 
 
985 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.61 
 
 
1082 aa  382  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.83 
 
 
1110 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  42.98 
 
 
1003 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  42.11 
 
 
1130 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.23 
 
 
1102 aa  379  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  40.12 
 
 
1250 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 
1403 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  38.6 
 
 
1163 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  44.09 
 
 
1025 aa  366  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  42.51 
 
 
1064 aa  364  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  38.22 
 
 
1437 aa  365  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.99 
 
 
1089 aa  365  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  42.11 
 
 
1064 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  40.46 
 
 
1084 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  41 
 
 
1084 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.64 
 
 
1081 aa  362  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  39.97 
 
 
1141 aa  361  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
1160 aa  361  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1066 aa  360  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  41.33 
 
 
1064 aa  360  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  41.33 
 
 
1064 aa  360  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  41.33 
 
 
1064 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  41.33 
 
 
1064 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>