More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1983 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  47.55 
 
 
1082 aa  1004    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1089 aa  2228    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.03 
 
 
1102 aa  918    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  40.89 
 
 
1394 aa  806    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.71 
 
 
1087 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.55 
 
 
1077 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.57 
 
 
907 aa  525  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
1069 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.5 
 
 
1125 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.1 
 
 
1084 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
1112 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.94 
 
 
1084 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.63 
 
 
1084 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.76 
 
 
1069 aa  459  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.65 
 
 
1069 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
1139 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.54 
 
 
1064 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  33.86 
 
 
1064 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.78 
 
 
1064 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  33.86 
 
 
1064 aa  436  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.05 
 
 
1064 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.24 
 
 
1064 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.05 
 
 
1064 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.05 
 
 
1064 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.6 
 
 
1064 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
1068 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
1066 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.37 
 
 
1091 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.46 
 
 
1068 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.48 
 
 
1068 aa  399  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  43.38 
 
 
1181 aa  391  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.39 
 
 
1071 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.28 
 
 
1069 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  33.07 
 
 
1031 aa  386  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
1068 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.06 
 
 
1062 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.51 
 
 
914 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.26 
 
 
1357 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.91 
 
 
1073 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 
1449 aa  380  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.99 
 
 
1104 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.51 
 
 
1134 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  40.91 
 
 
1070 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.31 
 
 
918 aa  376  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
1073 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
1073 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  42.23 
 
 
1073 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  41.2 
 
 
1150 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.97 
 
 
1155 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  41.47 
 
 
1082 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1086 aa  376  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
1055 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.23 
 
 
1091 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.27 
 
 
1178 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.55 
 
 
1034 aa  373  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  39.82 
 
 
1381 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
1118 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  44.18 
 
 
1100 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
1073 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  40.86 
 
 
1025 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.36 
 
 
1082 aa  370  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  41.36 
 
 
1082 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.2 
 
 
1080 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  38.45 
 
 
1090 aa  366  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.23 
 
 
991 aa  365  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.2 
 
 
1362 aa  363  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.44 
 
 
663 aa  363  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  43.76 
 
 
777 aa  361  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
1028 aa  361  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.72 
 
 
1386 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  41.85 
 
 
773 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  40.73 
 
 
1070 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
1129 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  37.08 
 
 
1354 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.62 
 
 
1088 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.18 
 
 
1127 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.43 
 
 
1088 aa  355  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39 
 
 
1403 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.23 
 
 
977 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 
918 aa  353  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 
1029 aa  353  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  39.48 
 
 
1088 aa  353  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.2 
 
 
918 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.2 
 
 
918 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.2 
 
 
918 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  40.61 
 
 
918 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.2 
 
 
918 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
1110 aa  352  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.2 
 
 
918 aa  352  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.2 
 
 
918 aa  352  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.71 
 
 
872 aa  352  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.73 
 
 
1154 aa  352  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  28.03 
 
 
1032 aa  351  4e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  40.4 
 
 
918 aa  351  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  42.8 
 
 
1209 aa  351  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.68 
 
 
1031 aa  350  7e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40 
 
 
918 aa  350  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.04 
 
 
896 aa  350  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
982 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>