More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1047 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  66.73 
 
 
1050 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  48.91 
 
 
1013 aa  825    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1028 aa  2012    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  66.34 
 
 
1074 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  42.86 
 
 
1033 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  45.39 
 
 
990 aa  742    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  42.44 
 
 
1007 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  39.94 
 
 
1006 aa  628  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  62.57 
 
 
1040 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  60.58 
 
 
1029 aa  582  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
1112 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  53.54 
 
 
1078 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  58.73 
 
 
1019 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  45.35 
 
 
958 aa  562  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  53.61 
 
 
1072 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
1048 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  47.72 
 
 
1026 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.17 
 
 
1007 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  38.52 
 
 
924 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.95 
 
 
933 aa  539  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.52 
 
 
1047 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  52.41 
 
 
1047 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  52.91 
 
 
1019 aa  528  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  38.17 
 
 
1048 aa  529  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.64 
 
 
918 aa  523  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.61 
 
 
918 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.61 
 
 
918 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.61 
 
 
918 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.48 
 
 
918 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
918 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.61 
 
 
918 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  37.07 
 
 
1065 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.48 
 
 
918 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.61 
 
 
918 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.61 
 
 
918 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  44.44 
 
 
988 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  36.7 
 
 
1175 aa  512  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.36 
 
 
925 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.28 
 
 
1067 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  34.96 
 
 
886 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.43 
 
 
1099 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  49.9 
 
 
980 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  49.58 
 
 
918 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  50.42 
 
 
1185 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  42.49 
 
 
917 aa  485  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  53.64 
 
 
621 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
898 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  52.86 
 
 
1063 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  49.89 
 
 
1531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  40.68 
 
 
901 aa  459  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  47.03 
 
 
1194 aa  455  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  44.17 
 
 
903 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  42.83 
 
 
1152 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  41.15 
 
 
902 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  50 
 
 
949 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  50.31 
 
 
899 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
892 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
895 aa  417  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
931 aa  406  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
617 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  44.63 
 
 
1021 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 
982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
1055 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  34.54 
 
 
1139 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.83 
 
 
1112 aa  373  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.5 
 
 
1087 aa  373  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.13 
 
 
1082 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  48.14 
 
 
1209 aa  362  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  42.09 
 
 
1068 aa  360  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.06 
 
 
1077 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.08 
 
 
977 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  44.15 
 
 
1082 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  44.15 
 
 
1082 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  43.97 
 
 
1082 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
1129 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  43.83 
 
 
1073 aa  356  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  43.36 
 
 
1062 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
1073 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.51 
 
 
964 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.8 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.73 
 
 
1134 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.67 
 
 
1068 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.35 
 
 
1071 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 
1073 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
1091 aa  350  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  39.87 
 
 
1127 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 
1073 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  42.51 
 
 
1178 aa  349  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  42.89 
 
 
1070 aa  348  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.65 
 
 
1069 aa  348  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  38.45 
 
 
1003 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
1089 aa  346  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.6 
 
 
1102 aa  346  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.03 
 
 
1088 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  44.44 
 
 
1112 aa  346  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.4 
 
 
1080 aa  345  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  40.44 
 
 
1161 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  43.55 
 
 
1068 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 
1113 aa  343  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
1261 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>