More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2328 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  41.08 
 
 		 1032 aa  788    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1034 aa  2117    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.43 
 
 		 1031 aa  802    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.42 
 
 		 1084 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  39.03 
 
 		 1064 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  33.43 
 
 		 1066 aa  499  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  38.5 
 
 		 1064 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 1068 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  38.76 
 
 		 1064 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  38.24 
 
 		 1064 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  38.37 
 
 		 1064 aa  493  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  38.24 
 
 		 1064 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  38.24 
 
 		 1064 aa  493  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  38.11 
 
 		 1064 aa  493  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  38.24 
 
 		 1064 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.41 
 
 		 1077 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.31 
 
 		 1087 aa  486  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 1082 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  32.63 
 
 		 1084 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  32.49 
 
 		 1084 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.54 
 
 		 1125 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.34 
 
 		 1139 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 1069 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.84 
 
 		 1069 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  30.17 
 
 		 1069 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.08 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.47 
 
 		 1082 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1089 aa  366  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  42.49 
 
 		 1181 aa  357  7.999999999999999e-97  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.86 
 
 		 1031 aa  353  7e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  34.87 
 
 		 1394 aa  350  9e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 		 1129 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.43 
 
 		 1086 aa  336  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 1104 aa  333  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.63 
 
 		 1130 aa  333  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.92 
 
 		 977 aa  332  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  38.18 
 
 		 1178 aa  331  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.08 
 
 		 1062 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.2 
 
 		 1362 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.75 
 
 		 1386 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.31 
 
 		 1134 aa  327  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.32 
 
 		 959 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  39.82 
 
 		 1250 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.78 
 
 		 1080 aa  321  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  37.13 
 
 		 1068 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 1118 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 1403 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  38.35 
 
 		 1127 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  35.22 
 
 		 1357 aa  318  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 1068 aa  318  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  39.79 
 
 		 896 aa  317  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  34.69 
 
 		 918 aa  317  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.53 
 
 		 1021 aa  317  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.19 
 
 		 964 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.25 
 
 		 1082 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.51 
 
 		 914 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 1113 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  36.71 
 
 		 1113 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.17 
 
 		 1068 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  36.98 
 
 		 1055 aa  315  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.43 
 
 		 1070 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1088 aa  313  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 		 876 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.31 
 
 		 1091 aa  313  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 1069 aa  313  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  31.97 
 
 		 1082 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.5 
 
 		 663 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 		 982 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.07 
 
 		 1088 aa  312  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  38.43 
 
 		 1164 aa  312  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.7 
 
 		 1071 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 1108 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  38.73 
 
 		 1082 aa  311  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  36 
 
 		 1150 aa  311  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  35.32 
 
 		 773 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.87 
 
 		 1209 aa  310  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 		 1120 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  38.12 
 
 		 1284 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  38.38 
 
 		 1073 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 		 1068 aa  309  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  38.91 
 
 		 1091 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  34.49 
 
 		 1163 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 		 1073 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.08 
 
 		 1070 aa  307  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  39.96 
 
 		 1088 aa  307  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 		 1155 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  37.35 
 
 		 918 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 		 1073 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  37.55 
 
 		 918 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 		 1073 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.19 
 
 		 1354 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 		 1105 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 		 918 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.99 
 
 		 1090 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  34.44 
 
 		 891 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  36.45 
 
 		 666 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.33 
 
 		 1100 aa  303  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  37.75 
 
 		 918 aa  303  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  37.75 
 
 		 918 aa  303  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>