More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1444 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  100 
 
 
891 aa  1831    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  39.97 
 
 
1130 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 
1055 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.46 
 
 
964 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.87 
 
 
1127 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  33.89 
 
 
1112 aa  366  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.47 
 
 
1129 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
1021 aa  361  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  43.04 
 
 
1087 aa  361  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.6 
 
 
914 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
1069 aa  353  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.24 
 
 
773 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.24 
 
 
663 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  38.7 
 
 
777 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
1066 aa  351  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.38 
 
 
918 aa  351  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.08 
 
 
1134 aa  350  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  41.41 
 
 
1071 aa  350  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 
1112 aa  350  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
1068 aa  349  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  43.04 
 
 
1125 aa  349  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.31 
 
 
1086 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
1155 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 
1139 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
982 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.63 
 
 
1250 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.49 
 
 
1068 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  39.57 
 
 
1150 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
1082 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32.27 
 
 
1062 aa  344  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
1120 aa  344  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.69 
 
 
1362 aa  344  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
1069 aa  343  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
1068 aa  343  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
1091 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.63 
 
 
1068 aa  343  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.79 
 
 
1091 aa  340  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 
1113 aa  341  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.04 
 
 
1113 aa  341  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  35.86 
 
 
1386 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
1104 aa  340  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  40.53 
 
 
896 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  39.44 
 
 
1108 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  39.66 
 
 
872 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  39.31 
 
 
666 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
1261 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.36 
 
 
1181 aa  334  5e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  39.82 
 
 
1100 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
1105 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  39.87 
 
 
1088 aa  333  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
876 aa  333  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
1105 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  37.85 
 
 
959 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.67 
 
 
977 aa  330  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39 
 
 
1070 aa  330  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
1403 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.8 
 
 
1003 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  39.04 
 
 
991 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  40.32 
 
 
1069 aa  329  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.92 
 
 
1082 aa  328  4.0000000000000003e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  38.99 
 
 
1088 aa  328  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  38.8 
 
 
1080 aa  327  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
1171 aa  327  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  39.48 
 
 
1084 aa  326  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.87 
 
 
1077 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
1112 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  36.59 
 
 
1120 aa  324  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  38.78 
 
 
1088 aa  324  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  35.88 
 
 
1142 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  35.05 
 
 
1437 aa  324  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
1073 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.63 
 
 
1069 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  32.04 
 
 
1086 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
1073 aa  322  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  31.72 
 
 
1082 aa  322  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
1073 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
1073 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  39.53 
 
 
1357 aa  321  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.61 
 
 
1073 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  37.37 
 
 
985 aa  320  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  38.55 
 
 
1082 aa  320  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  35.12 
 
 
1161 aa  320  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  36.24 
 
 
1120 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  37.61 
 
 
1006 aa  320  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  37.53 
 
 
918 aa  320  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  38.87 
 
 
1354 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  38.55 
 
 
1082 aa  320  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  39.53 
 
 
1031 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  38.07 
 
 
1070 aa  318  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
1068 aa  318  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
1110 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
918 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  37.32 
 
 
918 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  37.32 
 
 
918 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  37.32 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  37.32 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  37.32 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  36.29 
 
 
1072 aa  312  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  37.11 
 
 
918 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>