More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1618 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  100 
 
 
1032 aa  2131    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.08 
 
 
1034 aa  791    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  59.17 
 
 
1031 aa  1286    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.82 
 
 
1084 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
1066 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  38.27 
 
 
1064 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  38.12 
 
 
1064 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
1068 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  38.12 
 
 
1064 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  38.12 
 
 
1064 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  38.12 
 
 
1064 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  38.12 
 
 
1064 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  38.12 
 
 
1064 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  37.79 
 
 
1064 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  37.21 
 
 
1064 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.24 
 
 
1082 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.46 
 
 
1087 aa  426  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
1112 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.8 
 
 
1077 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  37.54 
 
 
1125 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  29.86 
 
 
1084 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
1069 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  29.42 
 
 
1084 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  34.05 
 
 
1069 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 
1139 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.9 
 
 
1069 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  37.08 
 
 
1394 aa  362  3e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.73 
 
 
1082 aa  360  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.53 
 
 
1102 aa  357  6.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1089 aa  341  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
1129 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.87 
 
 
1104 aa  326  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  31.33 
 
 
1031 aa  326  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.99 
 
 
1062 aa  324  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.88 
 
 
1163 aa  323  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  37.72 
 
 
1181 aa  323  9.999999999999999e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  39.42 
 
 
1130 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.59 
 
 
977 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  40.38 
 
 
1437 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  40.09 
 
 
985 aa  321  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  39.7 
 
 
1127 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
1069 aa  320  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
1068 aa  319  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.07 
 
 
1071 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.85 
 
 
959 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.42 
 
 
907 aa  317  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.82 
 
 
1068 aa  317  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  36.28 
 
 
914 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.7 
 
 
1088 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
918 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
1068 aa  316  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  36.4 
 
 
918 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.33 
 
 
1362 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  37.68 
 
 
1068 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.89 
 
 
1134 aa  315  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  38.44 
 
 
1250 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
1261 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.01 
 
 
1091 aa  314  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  36.63 
 
 
918 aa  314  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 
1118 aa  314  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  36.47 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  36.63 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  36.47 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  36.47 
 
 
918 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 
1403 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  34.88 
 
 
1086 aa  313  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  36.78 
 
 
991 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
918 aa  312  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  35.98 
 
 
1025 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  36.21 
 
 
918 aa  311  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.07 
 
 
1386 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  35.99 
 
 
918 aa  311  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
1155 aa  311  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  36.41 
 
 
918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  36.24 
 
 
918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  35.46 
 
 
1112 aa  308  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 
1449 aa  307  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  39.75 
 
 
872 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.06 
 
 
1080 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.39 
 
 
1073 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
1073 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
1113 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  38.43 
 
 
1113 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  39.87 
 
 
663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  37.74 
 
 
903 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
1108 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  38.49 
 
 
1088 aa  305  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  38.85 
 
 
1178 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.28 
 
 
1070 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  39.24 
 
 
773 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  39.02 
 
 
1150 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 
1073 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
876 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  36.22 
 
 
1357 aa  304  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.41 
 
 
1088 aa  304  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
1171 aa  304  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 
1073 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  38.99 
 
 
896 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  37.79 
 
 
777 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
1091 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>