More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3328 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  50 
 
 
1021 aa  994    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1066 aa  2172    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  50 
 
 
1055 aa  1026    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  73.57 
 
 
1068 aa  1583    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.48 
 
 
1261 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.81 
 
 
964 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
982 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.61 
 
 
977 aa  608  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40.29 
 
 
1003 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  38.72 
 
 
1250 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.63 
 
 
1112 aa  542  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  40.64 
 
 
959 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.43 
 
 
1068 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.14 
 
 
1130 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  44.04 
 
 
1127 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.22 
 
 
1069 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.87 
 
 
1068 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  38.94 
 
 
1071 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
1091 aa  512  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 
1068 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  44.78 
 
 
1062 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.93 
 
 
1129 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  49.49 
 
 
1088 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  49.29 
 
 
1088 aa  423  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.13 
 
 
1086 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.08 
 
 
914 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  47.31 
 
 
1091 aa  416  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  39.74 
 
 
918 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  45.31 
 
 
1080 aa  412  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
1155 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  45.21 
 
 
1134 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 
1104 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  35.53 
 
 
1150 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
966 aa  406  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  44.95 
 
 
1073 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.84 
 
 
1077 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  41.2 
 
 
1362 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  48.77 
 
 
773 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  43.66 
 
 
1125 aa  402  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  36.29 
 
 
1082 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  41.02 
 
 
1386 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
1120 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.12 
 
 
1113 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.4 
 
 
1087 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  40.27 
 
 
872 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.29 
 
 
1082 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  48.77 
 
 
663 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  49.12 
 
 
1113 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  44.44 
 
 
1082 aa  399  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  47.24 
 
 
1086 aa  396  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
1073 aa  396  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
1073 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
1073 aa  396  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  44.07 
 
 
1070 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
1073 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
1118 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 
876 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  46.35 
 
 
1088 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
1112 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  47.11 
 
 
1108 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  47.94 
 
 
1126 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
1171 aa  385  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
1082 aa  386  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
950 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
1105 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  36.85 
 
 
896 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  44.4 
 
 
1178 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  39.16 
 
 
1437 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  45.47 
 
 
1070 aa  383  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  47 
 
 
1105 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  47 
 
 
666 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  44.28 
 
 
777 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  44.96 
 
 
1100 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  41.1 
 
 
985 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  42.68 
 
 
1181 aa  371  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  39.76 
 
 
1381 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.94 
 
 
1110 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.65 
 
 
1163 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
1102 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  39.52 
 
 
1025 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  36.33 
 
 
1069 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.83 
 
 
1154 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1160 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
1403 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  44.87 
 
 
1209 aa  370  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.92 
 
 
1069 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  35.86 
 
 
891 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 
1139 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.39 
 
 
991 aa  366  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.16 
 
 
1143 aa  364  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
1164 aa  364  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  38.67 
 
 
1142 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
1069 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  35.01 
 
 
1064 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
848 aa  361  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  43.1 
 
 
1072 aa  360  7e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  34.47 
 
 
1064 aa  360  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
1066 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  38.47 
 
 
1120 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  37.44 
 
 
1096 aa  357  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>