More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1434 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  100 
 
 
621 aa  1255    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  50.73 
 
 
617 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  53.9 
 
 
1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  51.22 
 
 
1006 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  51.22 
 
 
1078 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  54.17 
 
 
1074 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  53.67 
 
 
1050 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.86 
 
 
1112 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.64 
 
 
1028 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  53.24 
 
 
1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  47.77 
 
 
1007 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  50.43 
 
 
1072 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.61 
 
 
1047 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.39 
 
 
1029 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.56 
 
 
925 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.8 
 
 
1007 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  51.62 
 
 
1013 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  51.4 
 
 
1047 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.4 
 
 
933 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  51.14 
 
 
924 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  49.58 
 
 
918 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  49.58 
 
 
918 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  51.42 
 
 
990 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  49.16 
 
 
918 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  49.58 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  49.37 
 
 
918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  49.37 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  49.37 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  49.37 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.31 
 
 
1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  49.37 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  49.37 
 
 
918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
918 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  50.2 
 
 
988 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  50.82 
 
 
1019 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  48.41 
 
 
1175 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  50.72 
 
 
1026 aa  439  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  47.07 
 
 
1531 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  50.42 
 
 
1033 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  46.65 
 
 
1185 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  47.52 
 
 
980 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  50 
 
 
958 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
1152 aa  425  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  47.08 
 
 
1048 aa  425  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  48.03 
 
 
886 aa  422  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  46.35 
 
 
1065 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  45.1 
 
 
1067 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  47.41 
 
 
1063 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  49.39 
 
 
949 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  49.59 
 
 
903 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  47.82 
 
 
1099 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 
898 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  45.96 
 
 
901 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  42.41 
 
 
1087 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  42.5 
 
 
1194 aa  382  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.91 
 
 
1077 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
1112 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 
1082 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  47.84 
 
 
917 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  44.65 
 
 
902 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  46.92 
 
 
931 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  44.92 
 
 
899 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  45.45 
 
 
1178 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 
1021 aa  362  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  42.88 
 
 
892 aa  359  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  48.9 
 
 
985 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  41.46 
 
 
1181 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  38.76 
 
 
1125 aa  355  8.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  47 
 
 
1104 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  41.41 
 
 
1068 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
1069 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 
1055 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  46.19 
 
 
1209 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  41.39 
 
 
1071 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
1073 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.68 
 
 
1102 aa  348  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.73 
 
 
1080 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
895 aa  347  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
1073 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  42.77 
 
 
1073 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
1073 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.26 
 
 
1108 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.65 
 
 
1088 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
1091 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  43.25 
 
 
1354 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.19 
 
 
1082 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  41.27 
 
 
1069 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
1139 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
982 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  43.27 
 
 
777 aa  342  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
1068 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.17 
 
 
1091 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.24 
 
 
1068 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  41.63 
 
 
1003 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.59 
 
 
1073 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  42 
 
 
1386 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  41.77 
 
 
1070 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.85 
 
 
1100 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
1113 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  44.2 
 
 
1113 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>